RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526116.5

EML3-215, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 3

Gene EML3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-215	ENST00000526116	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.65	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	MRC1	P22897	1456 aa		28.64	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	ITPK1	Q13572	414 aa		28.61	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.61	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.6	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.6	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.6	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	AK7	Q96M32	723 aa		28.59	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		28.59	■■■□□ 2.17
EML3-215	ENST00000526116	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		28.57	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	ARX	Q96QS3	562 aa		28.57	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	LGR6	Q9HBX8	967 aa		28.57	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.56	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		28.56	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.56	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.55	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	TJP1	Q07157	1748 aa		28.55	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	MSH5	O43196	834 aa		28.53	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	SSFA2	P28290	1259 aa		28.53	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	POLD1	P28340	1107 aa		28.53	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		28.52	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.52	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
EML3-215	ENST00000526116	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.51	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		28.5	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	UTRN	P46939	3433 aa		28.49	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	GNPAT	O15228	680 aa		28.49	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	28.49	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.49	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		28.48	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		28.48	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	FCHSD2	O94868	740 aa		28.48	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	PHF14	O94880	888 aa		28.48	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		28.48	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	SMIM5	Q71RC9	77 aa		28.47	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.46	■■■□□ 2.15
EML3-215	ENST00000526116	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.44	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	RALBP1	Q15311	655 aa		28.44	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		28.44	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		28.44	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	SLC39A6	Q13433	755 aa		28.42	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.4	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	RPS6KA4	O75676	772 aa		28.4	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	ADRA2B	P18089	450 aa		28.4	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
EML3-215	ENST00000526116	TEF	Q10587	303 aa		28.38	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		28.38	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.37	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		28.36	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		28.36	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.35	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	ZNF790	Q6PG37	636 aa		28.33	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		28.33	■■■□□ 2.13
EML3-215	ENST00000526116	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.32	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		28.32	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		28.32	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.31	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	RFC4	P35249	363 aa		28.3	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.29	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	GYS1	P13807	737 aa		28.29	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		28.29	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.29	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	MCM10	Q7L590	875 aa		28.28	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	CHD4	Q14839	1912 aa		28.28	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	NEFM	P07197	916 aa		28.27	■■■□□ 2.12
EML3-215	ENST00000526116	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.26	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	MMP10	P09238	476 aa		28.26	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.24	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.24	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		28.24	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	COL15A1	P39059	1388 aa		28.23	■■■□□ 2.11

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