RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARXQ96QS3 562 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARID3AQ99856 593 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF358Q9NW07 568 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 TTLL8A6PVC2 850 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC102BQ68D86 513 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 CNKSR1Q969H4 720 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPC1P35052 558 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 EPHA4P54764 986 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 NLRP3Q96P20 1036 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP3Q9Y6I4 520 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SFI1A8K8P3 1242 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATG7O95352 703 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 CENPCQ03188 943 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 DPYDQ12882 1025 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 MTFR1Q15390 333 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 TLR1Q15399 786 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 STK32AQ8WU08 396 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 M0R2N6 131 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAN1A2O60476 641 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMTNP53814 917 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEC13P55735 322 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 FOXK2Q01167 660 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF787Q6DD87 383 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 A6NJY4 79 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 BACH1O14867 736 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 TNS4Q8IZW8 715 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-410P-201ENST00000517006 RHOQP17081 205 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 NBPF15Q8N660 670 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTSQ03393 145 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 POU4F2Q12837 409 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 C4orf17Q53FE4 359 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC35F4A4IF30 521 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDK2AP1O14519 115 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 C21orf2O43822 256 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 LGR5O75473 907 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 TBCELQ5QJ74 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLAIN2Q9P270 581 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLA2G4AP47712 749 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 WDR44Q5JSH3 913 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 GNASQ5JWF2 1037 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 PHKA2P46019 1235 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 POTEAQ6S8J7 498 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 EML1O00423 815 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP4AP20648 1035 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 TEAD4Q15561 434 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 OCLNQ16625 522 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-410P-201ENST00000517006 CARNS1A5YM72 827 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPFIA3O75145 1194 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-410P-201ENST00000517006 IGFBP4P22692 258 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-410P-201ENST00000517006 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-410P-201ENST00000517006 WEE1P30291 646 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-410P-201ENST00000517006 VEGFBP49765 207 aa6.46□□□□□ -1.38
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