RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 TSPY26PQ9H489 355 aa8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLCB2Q00722 1185 aa8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.32□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALKQ9UM73 1620 aa8.31□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 CUL4AQ13619 759 aa8.31□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.31□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 RASEFQ8IZ41 740 aa8.31□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 MX1P20591 662 aa8.31□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 LARGE1O95461 756 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADCY5O95622 1261 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 TERF1P54274 439 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 METP08581 1390 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 MLECQ14165 292 aa8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 CBX1P83916 185 aa8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP2B3Q16720 1220 aa8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 DYNC1I1O14576 645 aa8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGSF3O75054 1194 aa8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPG7Q9UQ90 795 aa8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 FIBPO43427 364 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPC24Q8NBT2 197 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIAA0232Q92628 1395 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRB1P82279 1406 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 MBD3O95983 291 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 GNAI2P04899 355 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 RUFY3Q7L099 469 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTPRCP08575 1304 aa8.28□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 AK2P54819 239 aa8.27□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
RAPGEF6-211ENST00000512611 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYT1P21579 422 aa8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP44Q9H0E7 712 aa8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.27□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 MCM5P33992 734 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 FLIIQ13045 1269 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 REREQ9P2R6 1566 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 HMMRO75330 724 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSPA4P34932 840 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP8B2P98198 1209 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAMK4Q16566 473 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP7BP35670 1465 aa8.26□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 ST3GAL1Q11201 340 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 NECAB1Q8N987 351 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANXA1P04083 346 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTH1RQ03431 593 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 TTC14Q96N46 770 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 KDM4AO75164 1064 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.25□□□□□ -1.09
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms