RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 STK24Q9Y6E0 443 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 IVLP07476 585 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 PDIA5Q14554 519 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 IQUBQ8NA54 791 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 NEK11Q8NG66 645 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 KIF5CO60282 957 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 SHTN1A0MZ66 631 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 ELF1P32519 619 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 MNAT1P51948 309 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 GBP6Q6ZN66 633 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 CUX2O14529 1486 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 NEDD9Q14511 834 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 CRYMQ14894 314 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 TEKT1Q969V4 418 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 BICD1Q96G01 975 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 SKAP1Q86WV1 359 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 CAPN15O75808 1086 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 AP1G2O75843 785 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 FCHSD2O94868 740 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC175P0C221 793 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 TRPC1P48995 793 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 INF2Q27J81 1249 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC184Q52MB2 194 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 KCNB2Q92953 911 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 AK7Q96M32 723 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-216ENST00000507116 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 VCAM1P19320 739 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RBSNQ9H1K0 784 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MYOM3Q5VTT5 1437 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 DBN1Q16643 649 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM7Q9C029 511 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SMARCA4P51532 1647 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PEX14O75381 377 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NLRP1Q9C000 1473 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SMTNL1A8MU46 457 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SESN3P58005 492 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA2Q08379 1002 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.5 ms