RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 C8orf37Q96NL8 207 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 DIP2BQ9P265 1576 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A087WZG4 1122 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 FSD1Q9BTV5 496 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 GLI2P10070 1586 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 USP6P35125 1406 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 APPP05067 770 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP3K5Q99683 1374 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 SYNMO15061 1565 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 PTPRCP08575 1304 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ERC2O15083 957 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 NEK4P51957 841 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 SEC24BO95487 1268 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 WASHC4Q2M389 1173 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 GSE1Q14687 1217 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 STARD3NLO95772 234 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 IL2RBP14784 551 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 HYPKQ9NX55 129 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 VPS37DQ86XT2 251 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 CNTROBQ8N137 903 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TOM1O60784 492 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 MX1P20591 662 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 GBP4Q96PP9 640 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF790Q6PG37 636 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 USP19O94966 1318 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 FOSBP53539 338 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 NFKBIBQ15653 356 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PIK3R4Q99570 1358 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 A1BGP04217 495 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA0232Q92628 1395 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PTPRMP28827 1452 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 KDM4AO75164 1064 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 NUCB1Q02818 461 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP85Q6P2H3 762 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP7BP35670 1465 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 G3V3G9 751 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 PIK3C2BO00750 1634 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 C8orf34Q49A92 452 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 DCAF5Q96JK2 942 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 USP16Q9Y5T5 823 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 DDB1Q16531 1140 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRVP-201ENST00000482597 INSRP06213 1382 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms