RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476510.5

GTPBP2-208, Transcript of GTP binding protein 2, human

TSL 5

Gene GTPBP2, Length 2,816 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP2-208	ENST00000476510	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	SLIT3	O75094	1523 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	BTG4	Q9NY30	223 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	APBB1	O00213	710 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	CYP27B1	O15528	508 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	ALS2	Q96Q42	1657 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510		A0A0G2JS52	829 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	SEC24B	O95487	1268 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	MEGF6	O75095	1541 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	PHKG2	P15735	406 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	FLII	Q13045	1269 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	MEIS3	Q99687	375 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	ABCC4	O15439	1325 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	MYL6B	P14649	208 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	CABP4	P57796	275 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	CPD	O75976	1380 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	ARX	Q96QS3	562 aa		13.83	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.83	□□□□□ -0.19
GTPBP2-208	ENST00000476510	IL2RB	P14784	551 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	PTPRC	P08575	1304 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	BECN1	Q14457	450 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	RGS12	O14924	1447 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	TOM1	O60784	492 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	AAMP	Q13685	434 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	COL18A1	P39060	1754 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP2-208	ENST00000476510	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21	3e-6	■■□□□ 12.6
GTPBP2-208	ENST00000476510	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP2-208	ENST00000476510	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.76	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms