RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.48□□□□□ -0.89
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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RABGEF1-206ENST00000461017 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.34□□□□□ -0.91
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