RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHD4Q14839 1912 aa35.67■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITPK1Q13572 414 aa35.67■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SULT6B1Q6IMI4 303 aa35.66■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSFA2P28290 1259 aa35.65■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM5Q71RC9 77 aa35.65■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL13P35225 146 aa35.64■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf141Q5JVX7 400 aa35.62■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDRP35968 1356 aa35.62■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNPATO15228 680 aa35.61■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABP4P57796 275 aa35.61■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTHFSP49914 203 aa35.6■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD2APQ9Y5K6 639 aa35.58■■■■□ 3.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC4A9Q96Q91 983 aa35.55■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF831Q5JPB2 1677 aa35.55■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIN3BO60391 1043 aa35.51■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa35.5■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAPPC3LQ5T215 181 aa35.48■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMOX1P09601 288 aa35.47■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKAP4Q5JQC9 854 aa35.47■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa35.46■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCN11AQ9UI33 1791 aa35.45■■■■□ 3.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.44■■■■□ 3.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADRA2BP18089 450 aa35.43■■■■□ 3.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS6KA4O75676 772 aa35.41■■■■□ 3.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP10P09238 476 aa35.4■■■■□ 3.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLGN1Q8N2Q7 840 aa35.39■■■■□ 3.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC52A2Q9HAB3 445 aa35.38■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGR6Q9HBX8 967 aa35.38■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFC4P35249 363 aa35.37■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNMTO43148 476 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRKLP46109 303 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TJP1Q07157 1748 aa35.34■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GYS1P13807 737 aa35.33■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRC1P22897 1456 aa35.32■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WWC3Q9ULE0 1092 aa35.31■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4AP0C0L4 1744 aa35.3■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa35.27■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A6Q13433 755 aa35.26■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC10Q8IXB1 793 aa35.26■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP3Q9Y6F1 533 aa35.26■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF13BQ9NQT8 1826 aa35.26■■■■□ 3.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC87Q9NVE4 849 aa35.25■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf71Q711Q0 1435 aa35.23■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PXDNLA1KZ92 1463 aa35.23■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QTNF8P60827 252 aa35.23■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGFB2P61812 414 aa35.23■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCPQ6ZWJ8 1503 aa35.22■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP53Q96M91 514 aa35.21■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAS2L2Q8NHY3 880 aa35.2■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa35.2■■■■□ 3.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP10DQ9P241 1426 aa35.18■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP8Q14318 412 aa35.18■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JLW4 131 aa35.17■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.17■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSIG10Q8N0Z9 540 aa35.16■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZPR1O75312 459 aa35.14■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEFQ10587 303 aa35.14■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC5Q8N0Z6 440 aa35.14■■■■□ 3.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADCY9O60503 1353 aa35.13■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBR2Q8IWV8 1755 aa35.13■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPEP1P16444 411 aa35.13■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL17REQ8NFR9 667 aa35.13■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCS1LQ9Y276 419 aa35.13■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDR1Q08345 913 aa35.12■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USPL1Q5W0Q7 1092 aa35.11■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDCQ9Y266 331 aa35.11■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa35.11■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R1AP30153 589 aa35.1■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKAR2BP31323 418 aa35.1■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35.09■■■■□ 3.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL15A1P39059 1388 aa35.09■■■■□ 3.21
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