RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452979.5

HERC3-207, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HERC3, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-207ENST00000452979 CEP350Q5VT06 3117 aa16.14■□□□□ 0.18
HERC3-207ENST00000452979 GNPATO15228 680 aa16.13■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.13■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 KDRP35968 1356 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 MMP10P09238 476 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 HSPA6P17066 643 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 TGFB2P61812 414 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 IFFO2Q5TF58 517 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 ADRA2BP18089 450 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 DCAF5Q96JK2 942 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-207ENST00000452979 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 KIF3CO14782 793 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 C4AP0C0L4 1744 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 RPS6KA4O75676 772 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 A0A0G2JLW4 131 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 GYS1P13807 737 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 RFC4P35249 363 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 CABP4P57796 275 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 PANK3Q9H999 370 aa16.03■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 DPEP1P16444 411 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 MTHFSP49914 203 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 BCS1LQ9Y276 419 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.02■□□□□ 0.16
HERC3-207ENST00000452979 KCNA3P22001 575 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 TOMM70O94826 608 aa16■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 SCN11AQ9UI33 1791 aa16■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 TJP1Q07157 1748 aa15.99■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 FCHSD2O94868 740 aa15.99■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.99■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 APLP1P51693 650 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 IL13P35225 146 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 MORC1Q86VD1 984 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 PIM2Q9P1W9 311 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 TM4SF1P30408 202 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 FKBP8Q14318 412 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-207ENST00000452979 DDR1Q08345 913 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 SBF1O95248 1867 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 CHRNA5P30532 468 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 LGR6Q9HBX8 967 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 WDR90Q96KV7 1748 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 MRC1P22897 1456 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-207ENST00000452979 ZPR1O75312 459 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-207ENST00000452979 FSTL1Q12841 308 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms