RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 BTBD11A6QL63 1104 aa26.03■■□□□ 1.76
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HDDC3-202ENST00000394272 PANK1Q8TE04 598 aa26.03■■□□□ 1.76
HDDC3-202ENST00000394272 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HDDC3-202ENST00000394272 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.02■■□□□ 1.76
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HDDC3-202ENST00000394272 TRIM27P14373 513 aa26.02■■□□□ 1.76
HDDC3-202ENST00000394272 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.02■■□□□ 1.76
HDDC3-202ENST00000394272 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.01■■□□□ 1.75
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HDDC3-202ENST00000394272 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HDDC3-202ENST00000394272 HSPA1LP34931 641 aa26■■□□□ 1.75
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HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.99■■□□□ 1.75
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HDDC3-202ENST00000394272 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.98■■□□□ 1.75
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HDDC3-202ENST00000394272 COG6Q9Y2V7 657 aa25.98■■□□□ 1.75
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.97■■□□□ 1.75
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HDDC3-202ENST00000394272 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
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HDDC3-202ENST00000394272 HOXB7P09629 217 aa25.95■■□□□ 1.74
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HDDC3-202ENST00000394272 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.94■■□□□ 1.74
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HDDC3-202ENST00000394272 C8orf37Q96NL8 207 aa25.93■■□□□ 1.74
HDDC3-202ENST00000394272 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.92■■□□□ 1.74
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HDDC3-202ENST00000394272 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HDDC3-202ENST00000394272 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.91■■□□□ 1.74
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.91■■□□□ 1.74
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF790Q6PG37 636 aa25.91■■□□□ 1.74
HDDC3-202ENST00000394272 NGLY1Q96IV0 654 aa25.91■■□□□ 1.74
HDDC3-202ENST00000394272 TNS2Q63HR2 1409 aa25.91■■□□□ 1.74
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HDDC3-202ENST00000394272 CABP4P57796 275 aa25.9■■□□□ 1.74
HDDC3-202ENST00000394272 AAMPQ13685 434 aa25.89■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.89■■□□□ 1.73
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HDDC3-202ENST00000394272 STK31Q9BXU1 1019 aa25.88■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 PTPRCP08575 1304 aa25.88■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 EXOC5O00471 708 aa25.87■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.87■■□□□ 1.73
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HDDC3-202ENST00000394272 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.86■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.85■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 C5P01031 1676 aa25.85■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.85■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 G2E3Q7L622 706 aa25.85■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.85■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 NECTIN2Q92692 538 aa25.85■■□□□ 1.73
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HDDC3-202ENST00000394272 GLI3P10071 1580 aa25.84■■□□□ 1.73
HDDC3-202ENST00000394272 ITGB4P16144 1822 aa25.84■■□□□ 1.73
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
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HDDC3-202ENST00000394272 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.81■■□□□ 1.72
HDDC3-202ENST00000394272 FLIIQ13045 1269 aa25.8■■□□□ 1.72
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HDDC3-202ENST00000394272 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
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HDDC3-202ENST00000394272 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.77■■□□□ 1.72
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.77■■□□□ 1.72
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HDDC3-202ENST00000394272 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.76■■□□□ 1.71
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HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.75■■□□□ 1.71
HDDC3-202ENST00000394272 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
HDDC3-202ENST00000394272 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HDDC3-202ENST00000394272 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HDDC3-202ENST00000394272 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
HDDC3-202ENST00000394272 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HDDC3-202ENST00000394272 PIGBQ92521 554 aa25.74■■□□□ 1.71
HDDC3-202ENST00000394272 BCL9O00512 1426 aa25.74■■□□□ 1.71
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