RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.11■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 CACNA1FO60840 1977 aa23.1■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 AMPHP49418 695 aa23.1■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 DIP2AQ14689 1571 aa23.09■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 ZNF445P59923 1031 aa23.09■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 FLIIQ13045 1269 aa23.09■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 GNAI3P08754 354 aa23.08■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.08■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.08■■□□□ 1.29
CBX1-202ENST00000393408 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.08■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.08■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.07■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.07■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.07■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 ATP8B2P98198 1209 aa23.06■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.06■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.06■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 MX1P20591 662 aa23.06■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.05■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 NWD1Q149M9 1564 aa23.05■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 EID1Q9Y6B2 187 aa23.04■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.04■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 SLIT1O75093 1534 aa23.03■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 NEK4P51957 841 aa23.03■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 TBX22Q9Y458 520 aa23.03■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.03■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.03■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 STAP2Q9UGK3 403 aa23.02■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 TMX3Q96JJ7 454 aa23.02■■□□□ 1.28
CBX1-202ENST00000393408 CHMLP26374 656 aa23.01■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 MCM2P49736 904 aa23.01■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 NECTIN2Q92692 538 aa23.01■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 MAP3K5Q99683 1374 aa23.01■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 USP54Q70EL1 1684 aa23.01■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 HOXC9P31274 260 aa23■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 IL17REQ8NFR9 667 aa23■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 GPT2Q8TD30 523 aa23■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 MCCP23508 829 aa23■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 NLRP6P59044 892 aa23■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 ANAPC15P60006 121 aa23■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 BABAM1Q9NWV8 329 aa23■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 PALD1Q9ULE6 856 aa22.99■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 CUL4AQ13619 759 aa22.99■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 IL17RAQ96F46 866 aa22.98■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 USP44Q9H0E7 712 aa22.98■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.98■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 RILPL2Q969X0 211 aa22.98■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 AOX1Q06278 1338 aa22.97■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.97■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.97■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.96■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.96■■□□□ 1.27
CBX1-202ENST00000393408 RBSNQ9H1K0 784 aa22.95■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 BRD1O95696 1058 aa22.94■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 SSH3Q8TE77 659 aa22.94■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.93■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.93■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.92■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.92■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.91■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 RAB11FIP3O75154 756 aa22.9■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 POLA2Q14181 598 aa22.9■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.9■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 MBD3O95983 291 aa22.89■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.89■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 IL25Q9H293 177 aa22.89■■□□□ 1.26
CBX1-202ENST00000393408 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.89■■□□□ 1.25
CBX1-202ENST00000393408 ABTB2Q8N961 1025 aa22.89■■□□□ 1.25
CBX1-202ENST00000393408 LTN1O94822 1766 aa22.89■■□□□ 1.25
CBX1-202ENST00000393408 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.88■■□□□ 1.25
CBX1-202ENST00000393408 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CBX1-202ENST00000393408 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms