RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 UBXN4Q92575 508 aa10.05□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 USP26Q9BXU7 913 aa10.05□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 TTC36A6NLP5 189 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 TRDNQ13061 729 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 PKD2Q13563 968 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 JMYQ8N9B5 988 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 NBPF4Q96M43 638 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC171Q6TFL3 1326 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 BRD1O95696 1058 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 REXO1L1PQ8IX06 675 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 EXOC4Q96A65 974 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.04□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 LUZP1Q86V48 1076 aa10.03□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRN4CLQ8ND94 238 aa10.03□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 LIG1P18858 919 aa10.03□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 CORO7P57737 925 aa10.03□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.03□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.03□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 ERBB3P21860 1342 aa10.02□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 KIF3CO14782 793 aa10.02□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC192P0DO97 292 aa10.02□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 NEK4P51957 841 aa10.02□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 GBP6Q6ZN66 633 aa10.02□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.02□□□□□ -0.8
NHLRC3-201ENST00000379599 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 FIBPO43427 364 aa10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 KIF14Q15058 1648 aa10.02□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 SKILP12757 684 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 SETQ01105 290 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 TMX3Q96JJ7 454 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 IRAK4Q9NWZ3 460 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 VPS18Q9P253 973 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 MBD5Q9P267 1494 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 USP8P40818 1118 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 TADA2BQ86TJ2 420 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 IQUBQ8NA54 791 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 BORCS6Q96GS4 357 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 KLHL33A6NCF5 533 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 EFCAB13Q8IY85 973 aa10.01□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 PAX7P23759 505 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ARID5BQ14865 1188 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 SASH3O75995 380 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 TMF1P82094 1093 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM200AQ8TCP9 573 aa10□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 LIG3P49916 1009 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF75DP51815 510 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 E9PCH4 1651 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CAND2O75155 1236 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ERLIN2O94905 339 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIM27P14373 513 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 UBE2HP62256 183 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC27Q2M243 656 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 MIEF2Q96C03 454 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 CAMK4Q16566 473 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ITFG2Q969R8 447 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF428Q96B54 188 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 PSMD1Q99460 953 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 EPC1Q9H2F5 836 aa9.99□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 TBC1D8O95759 1140 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 MORC1Q86VD1 984 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.98□□□□□ -0.81
NHLRC3-201ENST00000379599 HOMER1Q86YM7 354 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131 ms