RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345348.9

TM7SF2-202, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF2, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-202ENST00000345348 MCM10Q7L590 875 aa26.34■■□□□ 1.81
TM7SF2-202ENST00000345348 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TM7SF2-202ENST00000345348 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.33■■□□□ 1.81
TM7SF2-202ENST00000345348 RIPK4P57078 832 aa26.33■■□□□ 1.81
TM7SF2-202ENST00000345348 TXNRD1Q16881 649 aa26.33■■□□□ 1.81
TM7SF2-202ENST00000345348 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.33■■□□□ 1.81
TM7SF2-202ENST00000345348 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TM7SF2-202ENST00000345348 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.32■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 PALLDQ8WX93 1383 aa26.32■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 TEFQ10587 303 aa26.32■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 DCTN1Q14203 1278 aa26.32■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 PROM2Q8N271 834 aa26.32■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.32■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 NEUROD2Q15784 382 aa26.31■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 ATG3Q9NT62 314 aa26.3■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 APAF1O14727 1248 aa26.3■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.27■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.27■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 PAPPAQ13219 1627 aa26.27■■□□□ 1.8
TM7SF2-202ENST00000345348 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.25■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 KCNQ4P56696 695 aa26.24■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 SLC39A6Q13433 755 aa26.24■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.24■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.23■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 SIK1P57059 783 aa26.23■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.23■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 BTBD11A6QL63 1104 aa26.22■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.21■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 C5P01031 1676 aa26.21■■□□□ 1.79
TM7SF2-202ENST00000345348 NBPF14Q5TI25 921 aa26.2■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.2■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.19■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.19■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 ATP6V1AP38606 617 aa26.19■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF790Q6PG37 636 aa26.19■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.17■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.17■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.16■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.16■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 ITPK1Q13572 414 aa26.15■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 KCNQ3O43525 872 aa26.14■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 STK32BQ9NY57 414 aa26.14■■□□□ 1.78
TM7SF2-202ENST00000345348 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 TJP1Q07157 1748 aa26.13■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 C4BP0C0L5 1744 aa26.13■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC27Q2M243 656 aa26.12■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 SLC15A2Q16348 729 aa26.11■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.11■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.11■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF827Q17R98 1081 aa26.11■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 AKT1S1Q96B36 256 aa26.11■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.1■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.1■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.1■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.09■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 WWC1Q8IX03 1113 aa26.09■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.09■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.08■■□□□ 1.77
TM7SF2-202ENST00000345348 NGEFQ8N5V2 710 aa26.07■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.07■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.06■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 AK7Q96M32 723 aa26.06■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.06■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 CHL1O00533 1208 aa26.05■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 CFAP44Q96MT7 982 aa26.05■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 IFT57Q9NWB7 429 aa26.04■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.03■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF853P0CG23 659 aa26.02■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 GNAI1P63096 354 aa26.02■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
TM7SF2-202ENST00000345348 GNPATO15228 680 aa26.01■■□□□ 1.75
TM7SF2-202ENST00000345348 STARD3NLO95772 234 aa26.01■■□□□ 1.75
TM7SF2-202ENST00000345348 MBIPQ9NS73 344 aa26■■□□□ 1.75
TM7SF2-202ENST00000345348 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.99■■□□□ 1.75
TM7SF2-202ENST00000345348 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.99■■□□□ 1.75
TM7SF2-202ENST00000345348 WDR63Q8IWG1 891 aa25.99■■□□□ 1.75
TM7SF2-202ENST00000345348 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.99■■□□□ 1.75
TM7SF2-202ENST00000345348 CASZ1Q86V15 1759 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms