RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 F6X3S4 739 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 ABCA3Q99758 1704 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 FLIIQ13045 1269 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 SPG7Q9UQ90 795 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-201ENST00000331789 PHKG2P15735 406 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 NUCB1Q02818 461 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 MEIS3Q99687 375 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 HOXB7P09629 217 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 GCC1Q96CN9 775 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 CYP27B1O15528 508 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 LNPKQ9C0E8 428 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 ATP10DQ9P241 1426 aa22.45■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.45■■□□□ 1.19
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 SLC39A6Q13433 755 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 CEP85Q6P2H3 762 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 ANXA1P04083 346 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 STRN4Q9NRL3 753 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 DCAF5Q96JK2 942 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 SEC24BO95487 1268 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 EVA1CP58658 441 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 ZNF790Q6PG37 636 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 DCTPP1Q9H773 170 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-201ENST00000331789 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 PROSER3Q2NL68 480 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 MRC1P22897 1456 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 C5P01031 1676 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 GNAI2P04899 355 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 GNAI3P08754 354 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 IL2RBP14784 551 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 CABP4P57796 275 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 USP44Q9H0E7 712 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 ADCY9O60503 1353 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 BTG4Q9NY30 223 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-201ENST00000331789 USP35Q9P2H5 1018 aa22.33■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 PDIA6Q15084 440 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 BEND3Q5T5X7 828 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 HMMRO75330 724 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 HYPKQ9NX55 129 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 BCL11AQ9H165 835 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 APBB1O00213 710 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-201ENST00000331789 ATP8B2P98198 1209 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms