RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 GNAI1P63096 354 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 TXNRD1Q16881 649 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 SPG7Q9UQ90 795 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 IFT57Q9NWB7 429 aa23.39■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 NEFLP07196 543 aa23.38■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.38■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.38■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K5Q99683 1374 aa23.37■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.36■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.36■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 CFAP44Q96MT7 982 aa23.35■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 BTAF1O14981 1849 aa23.35■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.34■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.33■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.33■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 CYP27B1O15528 508 aa23.33■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SYNE4-201ENST00000324444 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 PHKG2P15735 406 aa23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 STK32BQ9NY57 414 aa23.31■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF853P0CG23 659 aa23.3■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.3■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.29■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF428Q96B54 188 aa23.29■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 MRC1P22897 1456 aa23.29■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.29■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.29■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 SLC15A2Q16348 729 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 MCM10Q7L590 875 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 SPON1Q9HCB6 807 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SYNE4-201ENST00000324444 DCTN1Q14203 1278 aa23.27■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 IL17REQ8NFR9 667 aa23.27■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 CHL1O00533 1208 aa23.26■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.25■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 CASZ1Q86V15 1759 aa23.25■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.25■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 TEFQ10587 303 aa23.24■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 PAPPAQ13219 1627 aa23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB7AO95365 584 aa23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 DCAF5Q96JK2 942 aa23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 LGR6Q9HBX8 967 aa23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 MBIPQ9NS73 344 aa23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.21■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.21■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.21■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 ITGB4P16144 1822 aa23.2■■□□□ 1.31
SYNE4-201ENST00000324444 KCNQ4P56696 695 aa23.2■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF827Q17R98 1081 aa23.2■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.17■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 LY75O60449 1722 aa23.16■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 AKT1S1Q96B36 256 aa23.15■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.15■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.14■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 MTFR1LQ9H019 292 aa23.14■■□□□ 1.3
SYNE4-201ENST00000324444 MS4A1P11836 297 aa23.14■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 PTGER2P43116 358 aa23.14■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 BTBD11A6QL63 1104 aa23.13■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.13■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 FKBP8Q14318 412 aa23.12■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 VAMP4O75379 141 aa23.11■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.11■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 PALLDQ8WX93 1383 aa23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 KIF16BQ96L93 1317 aa23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 HOXB7P09629 217 aa23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 CABP4P57796 275 aa23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.09■■□□□ 1.29
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