RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 RGS12O14924 1447 aa18.38■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 SMC5Q8IY18 1101 aa18.38■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.37■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 PHKG2P15735 406 aa18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 EVA1CP58658 441 aa18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 C8orf34Q49A92 452 aa18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 STRN4Q9NRL3 753 aa18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 MEGF6O75095 1541 aa18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.35■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 ABCC6O95255 1503 aa18.35■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 HOXB7P09629 217 aa18.35■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 MEIS3Q99687 375 aa18.35■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 SIRT2Q8IXJ6 389 aa18.34■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18.34■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.33■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.33■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 GCC1Q96CN9 775 aa18.33■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 LNPKQ9C0E8 428 aa18.33■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.33■□□□□ 0.53
NICN1-201ENST00000273598 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.33■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 CYP27B1O15528 508 aa18.32■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 NUCB1Q02818 461 aa18.32■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 SLC39A6Q13433 755 aa18.32■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.31■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 DCAF5Q96JK2 942 aa18.31■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 MSH5O43196 834 aa18.31■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 BCL11AQ9H165 835 aa18.31■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.3■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 ANXA1P04083 346 aa18.3■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 USP35Q9P2H5 1018 aa18.3■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 ZNF790Q6PG37 636 aa18.3■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 NHSL1Q5SYE7 1610 aa18.29■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.29■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 CARD10Q9BWT7 1032 aa18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 CACNA1FO60840 1977 aa18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 CABP4P57796 275 aa18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 CEP85Q6P2H3 762 aa18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 IL2RBP14784 551 aa18.27■□□□□ 0.52
NICN1-201ENST00000273598 GNAI2P04899 355 aa18.26■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 GNAI3P08754 354 aa18.26■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 BTG4Q9NY30 223 aa18.26■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.26■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.26■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.25■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.25■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.25■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 HMMRO75330 724 aa18.25■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 DCTPP1Q9H773 170 aa18.25■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.24■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.24■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 APBB1O00213 710 aa18.24■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.24■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 ABCA3Q99758 1704 aa18.24■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 ATP10DQ9P241 1426 aa18.24■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.23■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.23■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 PROSER3Q2NL68 480 aa18.23■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.22■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 HYPKQ9NX55 129 aa18.22■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 SEC24BO95487 1268 aa18.21■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 USP44Q9H0E7 712 aa18.21■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 PIP4K2BP78356 416 aa18.21■□□□□ 0.51
NICN1-201ENST00000273598 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.21■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 MYL6BP14649 208 aa18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.2■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.19■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NICN1-201ENST00000273598 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms