RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.97■■■□□ 2.39
PRADC1-201ENST00000258083 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.97■■■□□ 2.39
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PRADC1-201ENST00000258083 ZNF831Q5JPB2 1677 aa29.97■■■□□ 2.39
PRADC1-201ENST00000258083 PPP2R1AP30153 589 aa29.96■■■□□ 2.39
PRADC1-201ENST00000258083 ATP6V1AP38606 617 aa29.96■■■□□ 2.39
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PRADC1-201ENST00000258083 SYT17Q9BSW7 474 aa29.96■■■□□ 2.39
PRADC1-201ENST00000258083 AK7Q96M32 723 aa29.95■■■□□ 2.39
PRADC1-201ENST00000258083 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.94■■■□□ 2.38
PRADC1-201ENST00000258083 UTRNP46939 3433 aa29.93■■■□□ 2.38
PRADC1-201ENST00000258083 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.93■■■□□ 2.38
PRADC1-201ENST00000258083 POLD1P28340 1107 aa29.93■■■□□ 2.38
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PRADC1-201ENST00000258083 CFAP53Q96M91 514 aa29.92■■■□□ 2.38
PRADC1-201ENST00000258083 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa29.91■■■□□ 2.38
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PRADC1-201ENST00000258083 LGR6Q9HBX8 967 aa29.9■■■□□ 2.38
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PRADC1-201ENST00000258083 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.84■■■□□ 2.37
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PRADC1-201ENST00000258083 PHF14O94880 888 aa29.83■■■□□ 2.37
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PRADC1-201ENST00000258083 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
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PRADC1-201ENST00000258083 SLC39A6Q13433 755 aa29.75■■■□□ 2.35
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PRADC1-201ENST00000258083 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.69■■■□□ 2.34
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PRADC1-201ENST00000258083 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
PRADC1-201ENST00000258083 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
PRADC1-201ENST00000258083 GYS1P13807 737 aa29.66■■■□□ 2.34
PRADC1-201ENST00000258083 NLGN1Q8N2Q7 840 aa29.66■■■□□ 2.34
PRADC1-201ENST00000258083 RFC4P35249 363 aa29.65■■■□□ 2.34
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PRADC1-201ENST00000258083 YY1P25490 414 aa29.64■■■□□ 2.34
PRADC1-201ENST00000258083 C4AP0C0L4 1744 aa29.64■■■□□ 2.34
PRADC1-201ENST00000258083 MMP10P09238 476 aa29.63■■■□□ 2.33
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PRADC1-201ENST00000258083 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
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PRADC1-201ENST00000258083 MCM10Q7L590 875 aa29.57■■■□□ 2.32
PRADC1-201ENST00000258083 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
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PRADC1-201ENST00000258083 STARD3NLO95772 234 aa29.55■■■□□ 2.32
PRADC1-201ENST00000258083 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.327e-8■■■□□ 15.3
PRADC1-201ENST00000258083 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.55■■■□□ 2.32
PRADC1-201ENST00000258083 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PRADC1-201ENST00000258083 KCNQ3O43525 872 aa29.54■■■□□ 2.32
PRADC1-201ENST00000258083 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PRADC1-201ENST00000258083 FKBP8Q14318 412 aa29.54■■■□□ 2.32
PRADC1-201ENST00000258083 C10orf71Q711Q0 1435 aa29.54■■■□□ 2.32
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