RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 ABCC4O15439 1325 aa26.88■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.88■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 AAMPQ13685 434 aa26.88■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 G2E3Q7L622 706 aa26.88■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.88■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.87■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 USP35Q9P2H5 1018 aa26.87■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.87■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 RGS12O14924 1447 aa26.85■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.84■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.83■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 STK31Q9BXU1 1019 aa26.83■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.83■■□□□ 1.89
RFXAP-201ENST00000255476 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.82■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 IL2RBP14784 551 aa26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 PTPRCP08575 1304 aa26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 ADAMTS2O95450 1211 aa26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.8■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 SLC39A6Q13433 755 aa26.79■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 DCAF5Q96JK2 942 aa26.79■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 CACNA1FO60840 1977 aa26.79■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 F6X3S4 739 aa26.78■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.77■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.77■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
RFXAP-201ENST00000255476 FLIIQ13045 1269 aa26.76■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.76■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.76■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.75■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF790Q6PG37 636 aa26.74■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 HOXB7P09629 217 aa26.73■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.73■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.73■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.73■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 ANXA1P04083 346 aa26.72■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 RGS3P49796 1198 aa26.72■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 MSH5O43196 834 aa26.72■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 MRC1P22897 1456 aa26.72■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 CABP4P57796 275 aa26.71■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.71■■□□□ 1.87
RFXAP-201ENST00000255476 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 C5P01031 1676 aa26.66■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 PROSER3Q2NL68 480 aa26.66■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 MEIS3Q99687 375 aa26.66■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.65■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.65■■□□□ 1.86
RFXAP-201ENST00000255476 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.64■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 DISP2A7MBM2 1401 aa26.63■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 NRAPQ86VF7 1730 aa26.63■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.62■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.61■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 CERKQ8TCT0 537 aa26.61■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.61■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.6■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 SMC5Q8IY18 1101 aa26.59■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 USP16Q9Y5T5 823 aa26.59■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.59■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.58■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.58■■□□□ 1.85
RFXAP-201ENST00000255476 PDE4AP27815 886 aa26.57■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 PDIA6Q15084 440 aa26.57■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.57■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.57■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 ATP10DQ9P241 1426 aa26.56■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 GLI3P10071 1580 aa26.55■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 ADCY9O60503 1353 aa26.55■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 EXOC5O00471 708 aa26.55■■□□□ 1.84
RFXAP-201ENST00000255476 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms