RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000067530.4

Vapb-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vapb, Length 7,029 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ccdc129Q14B48 1034 aa15.99■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Sh2d4bA6X942 431 aa15.99■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Lman1Q9D0F3 517 aa15.99■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ccdc183A2AJB1 534 aa15.99■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Mum1Q6DID5 682 aa15.99■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 IbspQ61711 324 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Apol7aB2RT54 418 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Pde4dQ01063 747 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Irgm2A0A140LIF8 407 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Fam184aE9PW83 1143 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cfap100Q80VN0 613 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Top1mtQ8R4U6 593 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Klc3Q91W40 508 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cwc27Q3TKY6 469 aa15.98■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 RbsnQ80Y56 783 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Kcnh5Q920E3 988 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 CastP51125 788 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Btbd11Q6GQW0 1109 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Smco2Q9DA21 347 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 MpripP97434 1024 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ttc21bQ0HA38 1315 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Bicdl1A0JNT9 577 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Iffo1Q8BXL9 562 aa15.97■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ift74Q8BKE9 600 aa15.96■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa15.96■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Skor1Q8BX46 964 aa15.96■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cfap57Q9D180 1249 aa15.96■□□□□ 0.15
Vapb-201ENSMUST00000067530 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa15.96■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 NapbP28663 298 aa15.96■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa15.96■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Jakmip1Q8BVL9 626 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Gbp1Q01514 589 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Fchsd2Q3USJ8 740 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Nutm1Q8BHP2 1126 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Acbd3Q8BMP6 525 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cep55Q8BT07 462 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Clip2Q9Z0H8 1047 aa15.95■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cct4P80315 539 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ccdc42Q5SV66 316 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Znf394Q9Z1D9 521 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Palm3A2TJV2 734 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Api5O35841 504 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Olfml1Q8BSH2 233 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Babam1Q3UI43 333 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Mctp2Q5RJH2 878 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Znf18Q810A1 556 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 LarsQ8BMJ2 1178 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 E9QMW4 1145 aa15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Srgap3Q812A2 1099 aa15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Pank1Q8K4K6 548 aa15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Jakmip3Q5DTN8 844 aa15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cdca7Q9D0M2 382 aa15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Mpp4Q6P7F1 635 aa15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Hs2st1Q8R3H7 356 aa15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Znf131Q8K3J5 619 aa15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cux1P53564 1515 aa15.93■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Tnni2P13412 182 aa15.92■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Skida1Q80YR3 822 aa15.92■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Gas8Q60779 478 aa15.92■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ces1hD3Z298 562 aa15.92■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Fam204aQ8C6C7 236 aa15.92■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Dusp27Q148W8 1138 aa15.91■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 SnrkQ8VDU5 748 aa15.91■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Taok3Q8BYC6 898 aa15.91■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Hdac9Q99N13 588 aa15.91■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 P4ha1Q60715 534 aa15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Taf12Q8VE65 161 aa15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ankrd35E9Q9D8 996 aa15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cers3Q1A3B0 383 aa15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ankrd49Q8VE42 238 aa15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 Q9D5Q8 446 aa15.9■□□□□ 0.14
Vapb-201ENSMUST00000067530 FerP70451 823 aa15.89■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Tdrd9Q14BI7 1383 aa15.89■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Cdr1E9Q0B4 517 aa15.89■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ampd3O08739 766 aa15.89■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Skor2A7M7C7 1008 aa15.89■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Prr29B1ARI9 187 aa15.89■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ift57Q8BXG3 429 aa15.89■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Pde4cQ3UEI1 686 aa15.88■□□□□ 0.13
Vapb-201ENSMUST00000067530 Ncf1Q09014 390 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15 ms