Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Rspo1Q9Z132 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rspo1Q9Z132 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rspo1Q9Z132 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rspo1Q9Z132 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rspo1Q9Z132 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rspo1Q9Z132 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rspo1Q9Z132 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rspo1Q9Z132 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rspo1Q9Z132 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rspo1Q9Z132 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rspo1Q9Z132 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rspo1Q9Z132 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rspo1Q9Z132 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rspo1Q9Z132 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rspo1Q9Z132 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rspo1Q9Z132 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rspo1Q9Z132 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rspo1Q9Z132 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rspo1Q9Z132 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rspo1Q9Z132 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rspo1Q9Z132 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rspo1Q9Z132 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rspo1Q9Z132 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rspo1Q9Z132 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rspo1Q9Z132 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rspo1Q9Z132 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rspo1Q9Z132 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rspo1Q9Z132 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rspo1Q9Z132 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rspo1Q9Z132 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rspo1Q9Z132 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rspo1Q9Z132 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rspo1Q9Z132 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rspo1Q9Z132 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rspo1Q9Z132 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rspo1Q9Z132 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rspo1Q9Z132 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rspo1Q9Z132 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rspo1Q9Z132 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rspo1Q9Z132 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rspo1Q9Z132 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rspo1Q9Z132 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rspo1Q9Z132 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rspo1Q9Z132 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rspo1Q9Z132 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rspo1Q9Z132 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rspo1Q9Z132 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rspo1Q9Z132 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rspo1Q9Z132 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rspo1Q9Z132 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rspo1Q9Z132 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rspo1Q9Z132 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rspo1Q9Z132 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rspo1Q9Z132 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rspo1Q9Z132 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rspo1Q9Z132 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rspo1Q9Z132 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rspo1Q9Z132 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rspo1Q9Z132 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rspo1Q9Z132 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rspo1Q9Z132 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rspo1Q9Z132 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rspo1Q9Z132 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rspo1Q9Z132 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rspo1Q9Z132 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rspo1Q9Z132 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rspo1Q9Z132 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rspo1Q9Z132 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rspo1Q9Z132 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rspo1Q9Z132 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rspo1Q9Z132 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rspo1Q9Z132 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rspo1Q9Z132 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rspo1Q9Z132 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rspo1Q9Z132 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rspo1Q9Z132 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rspo1Q9Z132 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rspo1Q9Z132 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rspo1Q9Z132 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rspo1Q9Z132 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rspo1Q9Z132 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rspo1Q9Z132 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rspo1Q9Z132 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rspo1Q9Z132 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rspo1Q9Z132 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rspo1Q9Z132 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rspo1Q9Z132 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rspo1Q9Z132 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rspo1Q9Z132 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rspo1Q9Z132 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rspo1Q9Z132 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rspo1Q9Z132 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rspo1Q9Z132 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rspo1Q9Z132 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rspo1Q9Z132 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rspo1Q9Z132 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rspo1Q9Z132 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rspo1Q9Z132 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rspo1Q9Z132 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms