Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U9

S1pr3, Sphingosine 1-phosphate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr3Q9Z0U9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
S1pr3Q9Z0U9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
S1pr3Q9Z0U9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
S1pr3Q9Z0U9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
S1pr3Q9Z0U9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
S1pr3Q9Z0U9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
S1pr3Q9Z0U9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
S1pr3Q9Z0U9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
S1pr3Q9Z0U9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
S1pr3Q9Z0U9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
S1pr3Q9Z0U9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
S1pr3Q9Z0U9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
S1pr3Q9Z0U9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
S1pr3Q9Z0U9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
S1pr3Q9Z0U9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
S1pr3Q9Z0U9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
S1pr3Q9Z0U9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
S1pr3Q9Z0U9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
S1pr3Q9Z0U9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
S1pr3Q9Z0U9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
S1pr3Q9Z0U9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
S1pr3Q9Z0U9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
S1pr3Q9Z0U9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
S1pr3Q9Z0U9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
S1pr3Q9Z0U9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
S1pr3Q9Z0U9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
S1pr3Q9Z0U9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
S1pr3Q9Z0U9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
S1pr3Q9Z0U9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
S1pr3Q9Z0U9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
S1pr3Q9Z0U9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
S1pr3Q9Z0U9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
S1pr3Q9Z0U9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
S1pr3Q9Z0U9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
S1pr3Q9Z0U9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
S1pr3Q9Z0U9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
S1pr3Q9Z0U9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
S1pr3Q9Z0U9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
S1pr3Q9Z0U9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
S1pr3Q9Z0U9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
S1pr3Q9Z0U9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
S1pr3Q9Z0U9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
S1pr3Q9Z0U9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
S1pr3Q9Z0U9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr3Q9Z0U9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
S1pr3Q9Z0U9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
S1pr3Q9Z0U9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
S1pr3Q9Z0U9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
S1pr3Q9Z0U9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
S1pr3Q9Z0U9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
S1pr3Q9Z0U9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
S1pr3Q9Z0U9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
S1pr3Q9Z0U9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
S1pr3Q9Z0U9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
S1pr3Q9Z0U9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
S1pr3Q9Z0U9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
S1pr3Q9Z0U9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
S1pr3Q9Z0U9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
S1pr3Q9Z0U9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
S1pr3Q9Z0U9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
S1pr3Q9Z0U9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
S1pr3Q9Z0U9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1pr3Q9Z0U9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1pr3Q9Z0U9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1pr3Q9Z0U9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1pr3Q9Z0U9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
S1pr3Q9Z0U9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
S1pr3Q9Z0U9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
S1pr3Q9Z0U9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
S1pr3Q9Z0U9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
S1pr3Q9Z0U9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
S1pr3Q9Z0U9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
S1pr3Q9Z0U9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1pr3Q9Z0U9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
S1pr3Q9Z0U9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1pr3Q9Z0U9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1pr3Q9Z0U9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1pr3Q9Z0U9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1pr3Q9Z0U9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1pr3Q9Z0U9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
S1pr3Q9Z0U9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
S1pr3Q9Z0U9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
S1pr3Q9Z0U9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1pr3Q9Z0U9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1pr3Q9Z0U9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1pr3Q9Z0U9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1pr3Q9Z0U9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1pr3Q9Z0U9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1pr3Q9Z0U9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1pr3Q9Z0U9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1pr3Q9Z0U9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1pr3Q9Z0U9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1pr3Q9Z0U9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
S1pr3Q9Z0U9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
S1pr3Q9Z0U9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
S1pr3Q9Z0U9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
S1pr3Q9Z0U9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
S1pr3Q9Z0U9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
S1pr3Q9Z0U9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
S1pr3Q9Z0U9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms