Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Cldn9Q9Z0S7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cldn9Q9Z0S7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cldn9Q9Z0S7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cldn9Q9Z0S7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cldn9Q9Z0S7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Cldn9Q9Z0S7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Cldn9Q9Z0S7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cldn9Q9Z0S7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cldn9Q9Z0S7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cldn9Q9Z0S7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Cldn9Q9Z0S7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cldn9Q9Z0S7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cldn9Q9Z0S7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cldn9Q9Z0S7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cldn9Q9Z0S7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cldn9Q9Z0S7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cldn9Q9Z0S7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cldn9Q9Z0S7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cldn9Q9Z0S7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cldn9Q9Z0S7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cldn9Q9Z0S7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cldn9Q9Z0S7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cldn9Q9Z0S7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cldn9Q9Z0S7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cldn9Q9Z0S7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cldn9Q9Z0S7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cldn9Q9Z0S7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cldn9Q9Z0S7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cldn9Q9Z0S7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cldn9Q9Z0S7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cldn9Q9Z0S7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cldn9Q9Z0S7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cldn9Q9Z0S7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cldn9Q9Z0S7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cldn9Q9Z0S7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cldn9Q9Z0S7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cldn9Q9Z0S7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cldn9Q9Z0S7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cldn9Q9Z0S7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cldn9Q9Z0S7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cldn9Q9Z0S7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cldn9Q9Z0S7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cldn9Q9Z0S7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cldn9Q9Z0S7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cldn9Q9Z0S7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cldn9Q9Z0S7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cldn9Q9Z0S7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cldn9Q9Z0S7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cldn9Q9Z0S7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cldn9Q9Z0S7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cldn9Q9Z0S7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cldn9Q9Z0S7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cldn9Q9Z0S7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cldn9Q9Z0S7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cldn9Q9Z0S7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cldn9Q9Z0S7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cldn9Q9Z0S7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cldn9Q9Z0S7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cldn9Q9Z0S7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cldn9Q9Z0S7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cldn9Q9Z0S7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cldn9Q9Z0S7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cldn9Q9Z0S7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cldn9Q9Z0S7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cldn9Q9Z0S7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cldn9Q9Z0S7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cldn9Q9Z0S7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cldn9Q9Z0S7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cldn9Q9Z0S7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cldn9Q9Z0S7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cldn9Q9Z0S7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cldn9Q9Z0S7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cldn9Q9Z0S7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cldn9Q9Z0S7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cldn9Q9Z0S7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cldn9Q9Z0S7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cldn9Q9Z0S7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cldn9Q9Z0S7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cldn9Q9Z0S7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cldn9Q9Z0S7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cldn9Q9Z0S7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cldn9Q9Z0S7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cldn9Q9Z0S7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cldn9Q9Z0S7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cldn9Q9Z0S7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cldn9Q9Z0S7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cldn9Q9Z0S7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cldn9Q9Z0S7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cldn9Q9Z0S7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cldn9Q9Z0S7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cldn9Q9Z0S7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms