Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cited4Q9WUL8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cited4Q9WUL8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cited4Q9WUL8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cited4Q9WUL8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cited4Q9WUL8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cited4Q9WUL8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cited4Q9WUL8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cited4Q9WUL8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cited4Q9WUL8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cited4Q9WUL8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cited4Q9WUL8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cited4Q9WUL8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cited4Q9WUL8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cited4Q9WUL8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cited4Q9WUL8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cited4Q9WUL8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cited4Q9WUL8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cited4Q9WUL8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cited4Q9WUL8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cited4Q9WUL8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cited4Q9WUL8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cited4Q9WUL8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cited4Q9WUL8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cited4Q9WUL8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cited4Q9WUL8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cited4Q9WUL8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cited4Q9WUL8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cited4Q9WUL8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cited4Q9WUL8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cited4Q9WUL8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cited4Q9WUL8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cited4Q9WUL8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cited4Q9WUL8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cited4Q9WUL8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cited4Q9WUL8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cited4Q9WUL8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cited4Q9WUL8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cited4Q9WUL8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cited4Q9WUL8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cited4Q9WUL8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cited4Q9WUL8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cited4Q9WUL8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cited4Q9WUL8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cited4Q9WUL8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cited4Q9WUL8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cited4Q9WUL8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cited4Q9WUL8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cited4Q9WUL8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cited4Q9WUL8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cited4Q9WUL8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cited4Q9WUL8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cited4Q9WUL8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cited4Q9WUL8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cited4Q9WUL8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cited4Q9WUL8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cited4Q9WUL8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cited4Q9WUL8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cited4Q9WUL8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cited4Q9WUL8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cited4Q9WUL8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cited4Q9WUL8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cited4Q9WUL8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cited4Q9WUL8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cited4Q9WUL8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cited4Q9WUL8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cited4Q9WUL8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cited4Q9WUL8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cited4Q9WUL8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cited4Q9WUL8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cited4Q9WUL8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cited4Q9WUL8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cited4Q9WUL8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cited4Q9WUL8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cited4Q9WUL8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cited4Q9WUL8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cited4Q9WUL8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cited4Q9WUL8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cited4Q9WUL8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cited4Q9WUL8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cited4Q9WUL8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cited4Q9WUL8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cited4Q9WUL8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cited4Q9WUL8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cited4Q9WUL8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cited4Q9WUL8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cited4Q9WUL8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cited4Q9WUL8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cited4Q9WUL8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cited4Q9WUL8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cited4Q9WUL8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cited4Q9WUL8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms