Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP5

Cdh22, Cadherin-22, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh22Q9WTP5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Cdh22Q9WTP5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdh22Q9WTP5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cdh22Q9WTP5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdh22Q9WTP5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cdh22Q9WTP5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdh22Q9WTP5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Cdh22Q9WTP5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Cdh22Q9WTP5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cdh22Q9WTP5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Cdh22Q9WTP5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Cdh22Q9WTP5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdh22Q9WTP5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cdh22Q9WTP5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cdh22Q9WTP5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdh22Q9WTP5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdh22Q9WTP5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cdh22Q9WTP5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdh22Q9WTP5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cdh22Q9WTP5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdh22Q9WTP5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdh22Q9WTP5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdh22Q9WTP5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdh22Q9WTP5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdh22Q9WTP5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdh22Q9WTP5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdh22Q9WTP5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdh22Q9WTP5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdh22Q9WTP5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdh22Q9WTP5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdh22Q9WTP5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdh22Q9WTP5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdh22Q9WTP5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdh22Q9WTP5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdh22Q9WTP5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdh22Q9WTP5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdh22Q9WTP5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdh22Q9WTP5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdh22Q9WTP5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdh22Q9WTP5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdh22Q9WTP5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdh22Q9WTP5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdh22Q9WTP5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdh22Q9WTP5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Cdh22Q9WTP5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdh22Q9WTP5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdh22Q9WTP5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdh22Q9WTP5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdh22Q9WTP5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdh22Q9WTP5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdh22Q9WTP5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdh22Q9WTP5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdh22Q9WTP5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdh22Q9WTP5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh22Q9WTP5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh22Q9WTP5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdh22Q9WTP5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdh22Q9WTP5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdh22Q9WTP5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdh22Q9WTP5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdh22Q9WTP5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdh22Q9WTP5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdh22Q9WTP5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdh22Q9WTP5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdh22Q9WTP5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdh22Q9WTP5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdh22Q9WTP5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdh22Q9WTP5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdh22Q9WTP5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdh22Q9WTP5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdh22Q9WTP5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdh22Q9WTP5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdh22Q9WTP5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdh22Q9WTP5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdh22Q9WTP5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdh22Q9WTP5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh22Q9WTP5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh22Q9WTP5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdh22Q9WTP5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh22Q9WTP5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh22Q9WTP5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdh22Q9WTP5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdh22Q9WTP5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdh22Q9WTP5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdh22Q9WTP5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdh22Q9WTP5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh22Q9WTP5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh22Q9WTP5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh22Q9WTP5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdh22Q9WTP5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdh22Q9WTP5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdh22Q9WTP5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdh22Q9WTP5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdh22Q9WTP5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdh22Q9WTP5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdh22Q9WTP5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh22Q9WTP5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh22Q9WTP5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdh22Q9WTP5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdh22Q9WTP5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms