Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Clca3a1Q9QX15 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clca3a1Q9QX15 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clca3a1Q9QX15 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clca3a1Q9QX15 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clca3a1Q9QX15 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clca3a1Q9QX15 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Clca3a1Q9QX15 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Clca3a1Q9QX15 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clca3a1Q9QX15 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Clca3a1Q9QX15 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clca3a1Q9QX15 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clca3a1Q9QX15 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Clca3a1Q9QX15 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clca3a1Q9QX15 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Clca3a1Q9QX15 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clca3a1Q9QX15 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clca3a1Q9QX15 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clca3a1Q9QX15 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Clca3a1Q9QX15 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clca3a1Q9QX15 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clca3a1Q9QX15 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clca3a1Q9QX15 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clca3a1Q9QX15 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clca3a1Q9QX15 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clca3a1Q9QX15 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clca3a1Q9QX15 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clca3a1Q9QX15 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Clca3a1Q9QX15 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clca3a1Q9QX15 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clca3a1Q9QX15 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clca3a1Q9QX15 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clca3a1Q9QX15 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clca3a1Q9QX15 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clca3a1Q9QX15 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clca3a1Q9QX15 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clca3a1Q9QX15 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clca3a1Q9QX15 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clca3a1Q9QX15 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Clca3a1Q9QX15 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clca3a1Q9QX15 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clca3a1Q9QX15 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clca3a1Q9QX15 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clca3a1Q9QX15 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clca3a1Q9QX15 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clca3a1Q9QX15 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clca3a1Q9QX15 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clca3a1Q9QX15 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Clca3a1Q9QX15 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Clca3a1Q9QX15 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clca3a1Q9QX15 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clca3a1Q9QX15 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca3a1Q9QX15 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clca3a1Q9QX15 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clca3a1Q9QX15 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clca3a1Q9QX15 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clca3a1Q9QX15 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clca3a1Q9QX15 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clca3a1Q9QX15 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clca3a1Q9QX15 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clca3a1Q9QX15 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clca3a1Q9QX15 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clca3a1Q9QX15 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clca3a1Q9QX15 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca3a1Q9QX15 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clca3a1Q9QX15 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clca3a1Q9QX15 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clca3a1Q9QX15 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Clca3a1Q9QX15 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clca3a1Q9QX15 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clca3a1Q9QX15 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clca3a1Q9QX15 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Clca3a1Q9QX15 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clca3a1Q9QX15 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clca3a1Q9QX15 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clca3a1Q9QX15 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clca3a1Q9QX15 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clca3a1Q9QX15 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clca3a1Q9QX15 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clca3a1Q9QX15 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clca3a1Q9QX15 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clca3a1Q9QX15 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clca3a1Q9QX15 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clca3a1Q9QX15 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clca3a1Q9QX15 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clca3a1Q9QX15 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clca3a1Q9QX15 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clca3a1Q9QX15 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clca3a1Q9QX15 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clca3a1Q9QX15 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clca3a1Q9QX15 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clca3a1Q9QX15 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clca3a1Q9QX15 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clca3a1Q9QX15 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clca3a1Q9QX15 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clca3a1Q9QX15 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clca3a1Q9QX15 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca3a1Q9QX15 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms