Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL60

Gmeb1, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gmeb1Q9JL60 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Gmeb1Q9JL60 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gmeb1Q9JL60 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gmeb1Q9JL60 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gmeb1Q9JL60 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gmeb1Q9JL60 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gmeb1Q9JL60 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gmeb1Q9JL60 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gmeb1Q9JL60 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gmeb1Q9JL60 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Gmeb1Q9JL60 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gmeb1Q9JL60 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gmeb1Q9JL60 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gmeb1Q9JL60 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gmeb1Q9JL60 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gmeb1Q9JL60 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gmeb1Q9JL60 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gmeb1Q9JL60 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gmeb1Q9JL60 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gmeb1Q9JL60 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gmeb1Q9JL60 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gmeb1Q9JL60 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gmeb1Q9JL60 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gmeb1Q9JL60 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gmeb1Q9JL60 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gmeb1Q9JL60 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gmeb1Q9JL60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gmeb1Q9JL60 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gmeb1Q9JL60 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gmeb1Q9JL60 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gmeb1Q9JL60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gmeb1Q9JL60 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gmeb1Q9JL60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gmeb1Q9JL60 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gmeb1Q9JL60 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gmeb1Q9JL60 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gmeb1Q9JL60 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gmeb1Q9JL60 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gmeb1Q9JL60 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gmeb1Q9JL60 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gmeb1Q9JL60 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gmeb1Q9JL60 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gmeb1Q9JL60 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gmeb1Q9JL60 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gmeb1Q9JL60 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gmeb1Q9JL60 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gmeb1Q9JL60 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gmeb1Q9JL60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gmeb1Q9JL60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gmeb1Q9JL60 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gmeb1Q9JL60 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gmeb1Q9JL60 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gmeb1Q9JL60 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gmeb1Q9JL60 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gmeb1Q9JL60 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gmeb1Q9JL60 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gmeb1Q9JL60 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gmeb1Q9JL60 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gmeb1Q9JL60 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gmeb1Q9JL60 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gmeb1Q9JL60 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gmeb1Q9JL60 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gmeb1Q9JL60 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gmeb1Q9JL60 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gmeb1Q9JL60 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gmeb1Q9JL60 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gmeb1Q9JL60 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gmeb1Q9JL60 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gmeb1Q9JL60 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gmeb1Q9JL60 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gmeb1Q9JL60 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gmeb1Q9JL60 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gmeb1Q9JL60 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gmeb1Q9JL60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gmeb1Q9JL60 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gmeb1Q9JL60 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gmeb1Q9JL60 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gmeb1Q9JL60 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gmeb1Q9JL60 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gmeb1Q9JL60 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gmeb1Q9JL60 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gmeb1Q9JL60 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gmeb1Q9JL60 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gmeb1Q9JL60 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gmeb1Q9JL60 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gmeb1Q9JL60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gmeb1Q9JL60 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gmeb1Q9JL60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gmeb1Q9JL60 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gmeb1Q9JL60 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gmeb1Q9JL60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gmeb1Q9JL60 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gmeb1Q9JL60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gmeb1Q9JL60 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gmeb1Q9JL60 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gmeb1Q9JL60 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gmeb1Q9JL60 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gmeb1Q9JL60 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gmeb1Q9JL60 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gmeb1Q9JL60 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms