Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ssna1Q9JJ94 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssna1Q9JJ94 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ssna1Q9JJ94 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssna1Q9JJ94 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssna1Q9JJ94 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ssna1Q9JJ94 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssna1Q9JJ94 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssna1Q9JJ94 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssna1Q9JJ94 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssna1Q9JJ94 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssna1Q9JJ94 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssna1Q9JJ94 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssna1Q9JJ94 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssna1Q9JJ94 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssna1Q9JJ94 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssna1Q9JJ94 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssna1Q9JJ94 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssna1Q9JJ94 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssna1Q9JJ94 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssna1Q9JJ94 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssna1Q9JJ94 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssna1Q9JJ94 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssna1Q9JJ94 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssna1Q9JJ94 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssna1Q9JJ94 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssna1Q9JJ94 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssna1Q9JJ94 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssna1Q9JJ94 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssna1Q9JJ94 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssna1Q9JJ94 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssna1Q9JJ94 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssna1Q9JJ94 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssna1Q9JJ94 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssna1Q9JJ94 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssna1Q9JJ94 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssna1Q9JJ94 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssna1Q9JJ94 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssna1Q9JJ94 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssna1Q9JJ94 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssna1Q9JJ94 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssna1Q9JJ94 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssna1Q9JJ94 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssna1Q9JJ94 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssna1Q9JJ94 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssna1Q9JJ94 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssna1Q9JJ94 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssna1Q9JJ94 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssna1Q9JJ94 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssna1Q9JJ94 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssna1Q9JJ94 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssna1Q9JJ94 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ssna1Q9JJ94 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssna1Q9JJ94 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssna1Q9JJ94 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssna1Q9JJ94 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssna1Q9JJ94 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssna1Q9JJ94 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssna1Q9JJ94 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssna1Q9JJ94 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssna1Q9JJ94 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssna1Q9JJ94 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssna1Q9JJ94 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssna1Q9JJ94 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssna1Q9JJ94 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssna1Q9JJ94 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssna1Q9JJ94 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssna1Q9JJ94 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssna1Q9JJ94 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssna1Q9JJ94 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssna1Q9JJ94 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssna1Q9JJ94 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssna1Q9JJ94 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssna1Q9JJ94 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssna1Q9JJ94 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssna1Q9JJ94 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssna1Q9JJ94 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssna1Q9JJ94 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssna1Q9JJ94 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssna1Q9JJ94 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssna1Q9JJ94 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssna1Q9JJ94 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssna1Q9JJ94 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssna1Q9JJ94 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssna1Q9JJ94 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssna1Q9JJ94 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssna1Q9JJ94 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssna1Q9JJ94 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssna1Q9JJ94 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssna1Q9JJ94 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssna1Q9JJ94 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssna1Q9JJ94 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssna1Q9JJ94 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssna1Q9JJ94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssna1Q9JJ94 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssna1Q9JJ94 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssna1Q9JJ94 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssna1Q9JJ94 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssna1Q9JJ94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssna1Q9JJ94 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms