Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC7

Ypel1, Protein yippee-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ypel1Q9ESC7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ypel1Q9ESC7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ypel1Q9ESC7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ypel1Q9ESC7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ypel1Q9ESC7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ypel1Q9ESC7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ypel1Q9ESC7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ypel1Q9ESC7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ypel1Q9ESC7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ypel1Q9ESC7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ypel1Q9ESC7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ypel1Q9ESC7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ypel1Q9ESC7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ypel1Q9ESC7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ypel1Q9ESC7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ypel1Q9ESC7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ypel1Q9ESC7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ypel1Q9ESC7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ypel1Q9ESC7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ypel1Q9ESC7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ypel1Q9ESC7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ypel1Q9ESC7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ypel1Q9ESC7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ypel1Q9ESC7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ypel1Q9ESC7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ypel1Q9ESC7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ypel1Q9ESC7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ypel1Q9ESC7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ypel1Q9ESC7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ypel1Q9ESC7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ypel1Q9ESC7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ypel1Q9ESC7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ypel1Q9ESC7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ypel1Q9ESC7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ypel1Q9ESC7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ypel1Q9ESC7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ypel1Q9ESC7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ypel1Q9ESC7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ypel1Q9ESC7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ypel1Q9ESC7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ypel1Q9ESC7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ypel1Q9ESC7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ypel1Q9ESC7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ypel1Q9ESC7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ypel1Q9ESC7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ypel1Q9ESC7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ypel1Q9ESC7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ypel1Q9ESC7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ypel1Q9ESC7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ypel1Q9ESC7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ypel1Q9ESC7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ypel1Q9ESC7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ypel1Q9ESC7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ypel1Q9ESC7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ypel1Q9ESC7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ypel1Q9ESC7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ypel1Q9ESC7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ypel1Q9ESC7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ypel1Q9ESC7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ypel1Q9ESC7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ypel1Q9ESC7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ypel1Q9ESC7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ypel1Q9ESC7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ypel1Q9ESC7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ypel1Q9ESC7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ypel1Q9ESC7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ypel1Q9ESC7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ypel1Q9ESC7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ypel1Q9ESC7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ypel1Q9ESC7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ypel1Q9ESC7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ypel1Q9ESC7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ypel1Q9ESC7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ypel1Q9ESC7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ypel1Q9ESC7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ypel1Q9ESC7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ypel1Q9ESC7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ypel1Q9ESC7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ypel1Q9ESC7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ypel1Q9ESC7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ypel1Q9ESC7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ypel1Q9ESC7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ypel1Q9ESC7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ypel1Q9ESC7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ypel1Q9ESC7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ypel1Q9ESC7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ypel1Q9ESC7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ypel1Q9ESC7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ypel1Q9ESC7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ypel1Q9ESC7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ypel1Q9ESC7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ypel1Q9ESC7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ypel1Q9ESC7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ypel1Q9ESC7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ypel1Q9ESC7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ypel1Q9ESC7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ypel1Q9ESC7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ypel1Q9ESC7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ypel1Q9ESC7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ypel1Q9ESC7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms