Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Clstn1Q9EPL2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Clstn1Q9EPL2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clstn1Q9EPL2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clstn1Q9EPL2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Clstn1Q9EPL2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Clstn1Q9EPL2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Clstn1Q9EPL2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clstn1Q9EPL2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Clstn1Q9EPL2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Clstn1Q9EPL2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clstn1Q9EPL2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clstn1Q9EPL2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Clstn1Q9EPL2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clstn1Q9EPL2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clstn1Q9EPL2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clstn1Q9EPL2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clstn1Q9EPL2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clstn1Q9EPL2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Clstn1Q9EPL2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clstn1Q9EPL2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Clstn1Q9EPL2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Clstn1Q9EPL2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Clstn1Q9EPL2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clstn1Q9EPL2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clstn1Q9EPL2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Clstn1Q9EPL2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clstn1Q9EPL2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clstn1Q9EPL2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Clstn1Q9EPL2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Clstn1Q9EPL2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clstn1Q9EPL2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clstn1Q9EPL2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clstn1Q9EPL2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Clstn1Q9EPL2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Clstn1Q9EPL2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clstn1Q9EPL2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clstn1Q9EPL2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clstn1Q9EPL2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clstn1Q9EPL2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clstn1Q9EPL2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Clstn1Q9EPL2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Clstn1Q9EPL2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Clstn1Q9EPL2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Clstn1Q9EPL2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Clstn1Q9EPL2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Clstn1Q9EPL2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Clstn1Q9EPL2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clstn1Q9EPL2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clstn1Q9EPL2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Clstn1Q9EPL2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clstn1Q9EPL2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Clstn1Q9EPL2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Clstn1Q9EPL2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Clstn1Q9EPL2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clstn1Q9EPL2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Clstn1Q9EPL2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clstn1Q9EPL2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clstn1Q9EPL2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clstn1Q9EPL2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Clstn1Q9EPL2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Clstn1Q9EPL2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clstn1Q9EPL2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clstn1Q9EPL2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clstn1Q9EPL2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clstn1Q9EPL2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clstn1Q9EPL2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clstn1Q9EPL2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clstn1Q9EPL2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clstn1Q9EPL2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clstn1Q9EPL2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clstn1Q9EPL2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Clstn1Q9EPL2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Clstn1Q9EPL2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Clstn1Q9EPL2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clstn1Q9EPL2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Clstn1Q9EPL2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clstn1Q9EPL2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clstn1Q9EPL2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Clstn1Q9EPL2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clstn1Q9EPL2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clstn1Q9EPL2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clstn1Q9EPL2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clstn1Q9EPL2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clstn1Q9EPL2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clstn1Q9EPL2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clstn1Q9EPL2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clstn1Q9EPL2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Clstn1Q9EPL2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Clstn1Q9EPL2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Clstn1Q9EPL2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clstn1Q9EPL2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clstn1Q9EPL2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clstn1Q9EPL2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clstn1Q9EPL2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clstn1Q9EPL2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clstn1Q9EPL2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clstn1Q9EPL2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms