Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc91Q9D8L5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc91Q9D8L5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc91Q9D8L5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
Ccdc91Q9D8L5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc91Q9D8L5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc91Q9D8L5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc91Q9D8L5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc91Q9D8L5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc91Q9D8L5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc91Q9D8L5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc91Q9D8L5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc91Q9D8L5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc91Q9D8L5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc91Q9D8L5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc91Q9D8L5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc91Q9D8L5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc91Q9D8L5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc91Q9D8L5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc91Q9D8L5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc91Q9D8L5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc91Q9D8L5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc91Q9D8L5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc91Q9D8L5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc91Q9D8L5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc91Q9D8L5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc91Q9D8L5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc91Q9D8L5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc91Q9D8L5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc91Q9D8L5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc91Q9D8L5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc91Q9D8L5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc91Q9D8L5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc91Q9D8L5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc91Q9D8L5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc91Q9D8L5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ccdc91Q9D8L5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc91Q9D8L5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc91Q9D8L5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc91Q9D8L5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc91Q9D8L5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc91Q9D8L5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc91Q9D8L5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc91Q9D8L5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc91Q9D8L5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc91Q9D8L5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc91Q9D8L5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc91Q9D8L5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc91Q9D8L5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc91Q9D8L5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ccdc91Q9D8L5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc91Q9D8L5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc91Q9D8L5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc91Q9D8L5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc91Q9D8L5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc91Q9D8L5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc91Q9D8L5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc91Q9D8L5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc91Q9D8L5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc91Q9D8L5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc91Q9D8L5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc91Q9D8L5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc91Q9D8L5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc91Q9D8L5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc91Q9D8L5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc91Q9D8L5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc91Q9D8L5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc91Q9D8L5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc91Q9D8L5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc91Q9D8L5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc91Q9D8L5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc91Q9D8L5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc91Q9D8L5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc91Q9D8L5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc91Q9D8L5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc91Q9D8L5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc91Q9D8L5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc91Q9D8L5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc91Q9D8L5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc91Q9D8L5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc91Q9D8L5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc91Q9D8L5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc91Q9D8L5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc91Q9D8L5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc91Q9D8L5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc91Q9D8L5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc91Q9D8L5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc91Q9D8L5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc91Q9D8L5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc91Q9D8L5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc91Q9D8L5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc91Q9D8L5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc91Q9D8L5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc91Q9D8L5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc91Q9D8L5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms