Protein–RNA interactions for Protein: Q9D820

Prorsd1, Prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prorsd1Q9D820 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Prorsd1Q9D820 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prorsd1Q9D820 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Prorsd1Q9D820 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prorsd1Q9D820 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Prorsd1Q9D820 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Prorsd1Q9D820 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Prorsd1Q9D820 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Prorsd1Q9D820 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Prorsd1Q9D820 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Prorsd1Q9D820 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Prorsd1Q9D820 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Prorsd1Q9D820 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Prorsd1Q9D820 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prorsd1Q9D820 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Prorsd1Q9D820 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Prorsd1Q9D820 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Prorsd1Q9D820 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Prorsd1Q9D820 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Prorsd1Q9D820 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Prorsd1Q9D820 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prorsd1Q9D820 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prorsd1Q9D820 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prorsd1Q9D820 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Prorsd1Q9D820 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prorsd1Q9D820 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prorsd1Q9D820 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prorsd1Q9D820 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Prorsd1Q9D820 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prorsd1Q9D820 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prorsd1Q9D820 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prorsd1Q9D820 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prorsd1Q9D820 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Prorsd1Q9D820 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prorsd1Q9D820 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prorsd1Q9D820 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prorsd1Q9D820 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prorsd1Q9D820 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prorsd1Q9D820 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prorsd1Q9D820 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prorsd1Q9D820 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prorsd1Q9D820 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prorsd1Q9D820 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prorsd1Q9D820 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prorsd1Q9D820 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prorsd1Q9D820 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prorsd1Q9D820 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prorsd1Q9D820 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prorsd1Q9D820 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prorsd1Q9D820 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Prorsd1Q9D820 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prorsd1Q9D820 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prorsd1Q9D820 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prorsd1Q9D820 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prorsd1Q9D820 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prorsd1Q9D820 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prorsd1Q9D820 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prorsd1Q9D820 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Prorsd1Q9D820 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Prorsd1Q9D820 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prorsd1Q9D820 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prorsd1Q9D820 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prorsd1Q9D820 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prorsd1Q9D820 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prorsd1Q9D820 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prorsd1Q9D820 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prorsd1Q9D820 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prorsd1Q9D820 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prorsd1Q9D820 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prorsd1Q9D820 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prorsd1Q9D820 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prorsd1Q9D820 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prorsd1Q9D820 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prorsd1Q9D820 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prorsd1Q9D820 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Prorsd1Q9D820 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prorsd1Q9D820 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prorsd1Q9D820 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prorsd1Q9D820 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prorsd1Q9D820 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prorsd1Q9D820 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prorsd1Q9D820 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prorsd1Q9D820 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prorsd1Q9D820 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prorsd1Q9D820 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prorsd1Q9D820 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prorsd1Q9D820 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prorsd1Q9D820 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prorsd1Q9D820 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prorsd1Q9D820 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prorsd1Q9D820 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prorsd1Q9D820 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prorsd1Q9D820 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prorsd1Q9D820 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prorsd1Q9D820 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prorsd1Q9D820 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prorsd1Q9D820 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Prorsd1Q9D820 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prorsd1Q9D820 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prorsd1Q9D820 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms