Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Cldn22Q9D7U6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cldn22Q9D7U6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cldn22Q9D7U6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cldn22Q9D7U6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cldn22Q9D7U6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cldn22Q9D7U6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Cldn22Q9D7U6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Cldn22Q9D7U6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Cldn22Q9D7U6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Cldn22Q9D7U6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cldn22Q9D7U6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cldn22Q9D7U6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cldn22Q9D7U6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cldn22Q9D7U6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cldn22Q9D7U6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Cldn22Q9D7U6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cldn22Q9D7U6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cldn22Q9D7U6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cldn22Q9D7U6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cldn22Q9D7U6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cldn22Q9D7U6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cldn22Q9D7U6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cldn22Q9D7U6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Cldn22Q9D7U6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Cldn22Q9D7U6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cldn22Q9D7U6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cldn22Q9D7U6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cldn22Q9D7U6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cldn22Q9D7U6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cldn22Q9D7U6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cldn22Q9D7U6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cldn22Q9D7U6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cldn22Q9D7U6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cldn22Q9D7U6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cldn22Q9D7U6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cldn22Q9D7U6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cldn22Q9D7U6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cldn22Q9D7U6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cldn22Q9D7U6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Cldn22Q9D7U6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cldn22Q9D7U6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cldn22Q9D7U6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cldn22Q9D7U6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cldn22Q9D7U6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cldn22Q9D7U6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cldn22Q9D7U6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cldn22Q9D7U6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cldn22Q9D7U6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cldn22Q9D7U6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cldn22Q9D7U6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Cldn22Q9D7U6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cldn22Q9D7U6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cldn22Q9D7U6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cldn22Q9D7U6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cldn22Q9D7U6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cldn22Q9D7U6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cldn22Q9D7U6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cldn22Q9D7U6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cldn22Q9D7U6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cldn22Q9D7U6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cldn22Q9D7U6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cldn22Q9D7U6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cldn22Q9D7U6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cldn22Q9D7U6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cldn22Q9D7U6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cldn22Q9D7U6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cldn22Q9D7U6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cldn22Q9D7U6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cldn22Q9D7U6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cldn22Q9D7U6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cldn22Q9D7U6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cldn22Q9D7U6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cldn22Q9D7U6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cldn22Q9D7U6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cldn22Q9D7U6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cldn22Q9D7U6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cldn22Q9D7U6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cldn22Q9D7U6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cldn22Q9D7U6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cldn22Q9D7U6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cldn22Q9D7U6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cldn22Q9D7U6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cldn22Q9D7U6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cldn22Q9D7U6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cldn22Q9D7U6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cldn22Q9D7U6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cldn22Q9D7U6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cldn22Q9D7U6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cldn22Q9D7U6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cldn22Q9D7U6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cldn22Q9D7U6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cldn22Q9D7U6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cldn22Q9D7U6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cldn22Q9D7U6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cldn22Q9D7U6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cldn22Q9D7U6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms