Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap5s1Q9D742 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap5s1Q9D742 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ap5s1Q9D742 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap5s1Q9D742 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap5s1Q9D742 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap5s1Q9D742 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap5s1Q9D742 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap5s1Q9D742 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap5s1Q9D742 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap5s1Q9D742 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap5s1Q9D742 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap5s1Q9D742 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap5s1Q9D742 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap5s1Q9D742 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap5s1Q9D742 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap5s1Q9D742 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap5s1Q9D742 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ap5s1Q9D742 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap5s1Q9D742 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap5s1Q9D742 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap5s1Q9D742 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap5s1Q9D742 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap5s1Q9D742 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap5s1Q9D742 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap5s1Q9D742 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap5s1Q9D742 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap5s1Q9D742 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap5s1Q9D742 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap5s1Q9D742 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap5s1Q9D742 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap5s1Q9D742 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap5s1Q9D742 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap5s1Q9D742 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap5s1Q9D742 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap5s1Q9D742 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap5s1Q9D742 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap5s1Q9D742 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap5s1Q9D742 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ap5s1Q9D742 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap5s1Q9D742 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap5s1Q9D742 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap5s1Q9D742 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap5s1Q9D742 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap5s1Q9D742 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap5s1Q9D742 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap5s1Q9D742 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap5s1Q9D742 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap5s1Q9D742 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap5s1Q9D742 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap5s1Q9D742 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap5s1Q9D742 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap5s1Q9D742 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap5s1Q9D742 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap5s1Q9D742 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap5s1Q9D742 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap5s1Q9D742 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap5s1Q9D742 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap5s1Q9D742 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap5s1Q9D742 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap5s1Q9D742 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap5s1Q9D742 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap5s1Q9D742 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap5s1Q9D742 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap5s1Q9D742 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap5s1Q9D742 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap5s1Q9D742 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap5s1Q9D742 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap5s1Q9D742 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap5s1Q9D742 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap5s1Q9D742 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap5s1Q9D742 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap5s1Q9D742 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap5s1Q9D742 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap5s1Q9D742 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap5s1Q9D742 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap5s1Q9D742 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap5s1Q9D742 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap5s1Q9D742 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap5s1Q9D742 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap5s1Q9D742 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap5s1Q9D742 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap5s1Q9D742 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap5s1Q9D742 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap5s1Q9D742 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap5s1Q9D742 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap5s1Q9D742 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap5s1Q9D742 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap5s1Q9D742 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap5s1Q9D742 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap5s1Q9D742 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap5s1Q9D742 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap5s1Q9D742 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap5s1Q9D742 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap5s1Q9D742 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap5s1Q9D742 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap5s1Q9D742 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap5s1Q9D742 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap5s1Q9D742 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap5s1Q9D742 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms