Protein–RNA interactions for Protein: Q9D486

Cmip, C-Maf-inducing protein, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CmipQ9D486 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CmipQ9D486 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CmipQ9D486 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CmipQ9D486 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CmipQ9D486 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CmipQ9D486 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CmipQ9D486 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CmipQ9D486 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CmipQ9D486 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CmipQ9D486 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CmipQ9D486 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CmipQ9D486 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CmipQ9D486 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CmipQ9D486 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CmipQ9D486 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CmipQ9D486 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CmipQ9D486 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CmipQ9D486 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CmipQ9D486 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CmipQ9D486 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CmipQ9D486 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CmipQ9D486 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CmipQ9D486 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CmipQ9D486 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CmipQ9D486 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CmipQ9D486 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CmipQ9D486 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CmipQ9D486 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CmipQ9D486 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CmipQ9D486 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CmipQ9D486 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CmipQ9D486 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CmipQ9D486 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CmipQ9D486 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CmipQ9D486 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CmipQ9D486 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CmipQ9D486 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CmipQ9D486 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CmipQ9D486 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CmipQ9D486 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CmipQ9D486 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CmipQ9D486 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CmipQ9D486 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CmipQ9D486 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CmipQ9D486 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CmipQ9D486 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CmipQ9D486 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CmipQ9D486 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CmipQ9D486 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CmipQ9D486 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CmipQ9D486 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CmipQ9D486 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CmipQ9D486 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CmipQ9D486 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CmipQ9D486 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CmipQ9D486 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CmipQ9D486 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CmipQ9D486 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CmipQ9D486 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CmipQ9D486 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CmipQ9D486 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CmipQ9D486 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CmipQ9D486 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CmipQ9D486 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CmipQ9D486 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CmipQ9D486 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CmipQ9D486 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CmipQ9D486 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CmipQ9D486 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CmipQ9D486 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CmipQ9D486 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CmipQ9D486 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CmipQ9D486 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CmipQ9D486 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CmipQ9D486 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CmipQ9D486 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CmipQ9D486 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CmipQ9D486 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CmipQ9D486 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CmipQ9D486 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CmipQ9D486 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CmipQ9D486 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CmipQ9D486 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CmipQ9D486 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CmipQ9D486 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CmipQ9D486 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CmipQ9D486 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CmipQ9D486 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CmipQ9D486 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CmipQ9D486 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CmipQ9D486 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CmipQ9D486 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CmipQ9D486 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CmipQ9D486 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CmipQ9D486 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CmipQ9D486 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CmipQ9D486 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CmipQ9D486 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CmipQ9D486 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CmipQ9D486 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms