Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
OxsmQ9D404 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
OxsmQ9D404 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
OxsmQ9D404 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
OxsmQ9D404 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OxsmQ9D404 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
OxsmQ9D404 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
OxsmQ9D404 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
OxsmQ9D404 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
OxsmQ9D404 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OxsmQ9D404 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OxsmQ9D404 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
OxsmQ9D404 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OxsmQ9D404 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OxsmQ9D404 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
OxsmQ9D404 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OxsmQ9D404 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OxsmQ9D404 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OxsmQ9D404 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OxsmQ9D404 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OxsmQ9D404 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OxsmQ9D404 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OxsmQ9D404 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OxsmQ9D404 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OxsmQ9D404 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OxsmQ9D404 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OxsmQ9D404 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OxsmQ9D404 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OxsmQ9D404 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OxsmQ9D404 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OxsmQ9D404 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OxsmQ9D404 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OxsmQ9D404 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OxsmQ9D404 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
OxsmQ9D404 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OxsmQ9D404 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OxsmQ9D404 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OxsmQ9D404 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OxsmQ9D404 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OxsmQ9D404 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OxsmQ9D404 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OxsmQ9D404 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OxsmQ9D404 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OxsmQ9D404 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OxsmQ9D404 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OxsmQ9D404 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OxsmQ9D404 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OxsmQ9D404 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OxsmQ9D404 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
OxsmQ9D404 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OxsmQ9D404 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OxsmQ9D404 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OxsmQ9D404 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OxsmQ9D404 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OxsmQ9D404 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OxsmQ9D404 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OxsmQ9D404 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OxsmQ9D404 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OxsmQ9D404 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OxsmQ9D404 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OxsmQ9D404 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OxsmQ9D404 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OxsmQ9D404 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OxsmQ9D404 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OxsmQ9D404 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OxsmQ9D404 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OxsmQ9D404 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OxsmQ9D404 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OxsmQ9D404 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OxsmQ9D404 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OxsmQ9D404 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OxsmQ9D404 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OxsmQ9D404 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OxsmQ9D404 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OxsmQ9D404 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OxsmQ9D404 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OxsmQ9D404 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OxsmQ9D404 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OxsmQ9D404 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OxsmQ9D404 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OxsmQ9D404 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OxsmQ9D404 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OxsmQ9D404 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OxsmQ9D404 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OxsmQ9D404 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
OxsmQ9D404 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OxsmQ9D404 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OxsmQ9D404 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OxsmQ9D404 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OxsmQ9D404 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OxsmQ9D404 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OxsmQ9D404 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OxsmQ9D404 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OxsmQ9D404 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OxsmQ9D404 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OxsmQ9D404 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OxsmQ9D404 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OxsmQ9D404 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OxsmQ9D404 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OxsmQ9D404 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms