Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Krtap5-3Q9D226 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Krtap5-3Q9D226 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Krtap5-3Q9D226 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Krtap5-3Q9D226 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Krtap5-3Q9D226 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Krtap5-3Q9D226 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Krtap5-3Q9D226 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Krtap5-3Q9D226 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Krtap5-3Q9D226 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Krtap5-3Q9D226 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Krtap5-3Q9D226 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Krtap5-3Q9D226 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Krtap5-3Q9D226 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Krtap5-3Q9D226 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Krtap5-3Q9D226 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Krtap5-3Q9D226 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Krtap5-3Q9D226 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Krtap5-3Q9D226 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Krtap5-3Q9D226 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Krtap5-3Q9D226 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Krtap5-3Q9D226 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Krtap5-3Q9D226 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Krtap5-3Q9D226 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Krtap5-3Q9D226 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Krtap5-3Q9D226 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Krtap5-3Q9D226 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Krtap5-3Q9D226 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Krtap5-3Q9D226 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Krtap5-3Q9D226 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Krtap5-3Q9D226 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Krtap5-3Q9D226 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Krtap5-3Q9D226 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Krtap5-3Q9D226 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Krtap5-3Q9D226 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Krtap5-3Q9D226 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Krtap5-3Q9D226 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Krtap5-3Q9D226 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Krtap5-3Q9D226 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Krtap5-3Q9D226 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Krtap5-3Q9D226 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Krtap5-3Q9D226 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Krtap5-3Q9D226 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Krtap5-3Q9D226 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Krtap5-3Q9D226 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Krtap5-3Q9D226 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Krtap5-3Q9D226 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Krtap5-3Q9D226 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Krtap5-3Q9D226 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Krtap5-3Q9D226 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Krtap5-3Q9D226 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Krtap5-3Q9D226 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Krtap5-3Q9D226 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Krtap5-3Q9D226 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Krtap5-3Q9D226 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Krtap5-3Q9D226 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Krtap5-3Q9D226 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Krtap5-3Q9D226 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Krtap5-3Q9D226 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Krtap5-3Q9D226 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Krtap5-3Q9D226 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Krtap5-3Q9D226 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Krtap5-3Q9D226 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Krtap5-3Q9D226 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Krtap5-3Q9D226 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Krtap5-3Q9D226 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Krtap5-3Q9D226 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Krtap5-3Q9D226 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Krtap5-3Q9D226 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Krtap5-3Q9D226 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Krtap5-3Q9D226 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Krtap5-3Q9D226 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Krtap5-3Q9D226 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Krtap5-3Q9D226 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Krtap5-3Q9D226 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Krtap5-3Q9D226 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Krtap5-3Q9D226 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Krtap5-3Q9D226 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Krtap5-3Q9D226 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Krtap5-3Q9D226 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Krtap5-3Q9D226 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Krtap5-3Q9D226 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Krtap5-3Q9D226 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Krtap5-3Q9D226 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Krtap5-3Q9D226 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Krtap5-3Q9D226 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Krtap5-3Q9D226 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Krtap5-3Q9D226 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Krtap5-3Q9D226 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Krtap5-3Q9D226 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Krtap5-3Q9D226 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Krtap5-3Q9D226 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Krtap5-3Q9D226 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Krtap5-3Q9D226 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Krtap5-3Q9D226 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Krtap5-3Q9D226 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Krtap5-3Q9D226 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Krtap5-3Q9D226 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Krtap5-3Q9D226 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms