Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG1

Chac2, Putative glutathione-specific gamma-glutamylcyclotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chac2Q9CQG1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Chac2Q9CQG1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chac2Q9CQG1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chac2Q9CQG1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chac2Q9CQG1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chac2Q9CQG1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chac2Q9CQG1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chac2Q9CQG1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Chac2Q9CQG1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chac2Q9CQG1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chac2Q9CQG1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chac2Q9CQG1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chac2Q9CQG1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Chac2Q9CQG1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chac2Q9CQG1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chac2Q9CQG1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chac2Q9CQG1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chac2Q9CQG1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chac2Q9CQG1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chac2Q9CQG1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chac2Q9CQG1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chac2Q9CQG1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chac2Q9CQG1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chac2Q9CQG1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chac2Q9CQG1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chac2Q9CQG1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chac2Q9CQG1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chac2Q9CQG1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chac2Q9CQG1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chac2Q9CQG1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chac2Q9CQG1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chac2Q9CQG1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chac2Q9CQG1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chac2Q9CQG1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chac2Q9CQG1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chac2Q9CQG1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chac2Q9CQG1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chac2Q9CQG1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chac2Q9CQG1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chac2Q9CQG1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chac2Q9CQG1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chac2Q9CQG1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chac2Q9CQG1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chac2Q9CQG1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chac2Q9CQG1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chac2Q9CQG1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chac2Q9CQG1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chac2Q9CQG1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chac2Q9CQG1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chac2Q9CQG1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chac2Q9CQG1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chac2Q9CQG1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chac2Q9CQG1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chac2Q9CQG1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chac2Q9CQG1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chac2Q9CQG1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chac2Q9CQG1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chac2Q9CQG1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chac2Q9CQG1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chac2Q9CQG1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chac2Q9CQG1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chac2Q9CQG1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chac2Q9CQG1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chac2Q9CQG1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chac2Q9CQG1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chac2Q9CQG1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chac2Q9CQG1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chac2Q9CQG1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chac2Q9CQG1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chac2Q9CQG1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chac2Q9CQG1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chac2Q9CQG1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chac2Q9CQG1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chac2Q9CQG1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chac2Q9CQG1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chac2Q9CQG1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chac2Q9CQG1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chac2Q9CQG1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chac2Q9CQG1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chac2Q9CQG1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chac2Q9CQG1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chac2Q9CQG1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chac2Q9CQG1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chac2Q9CQG1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chac2Q9CQG1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chac2Q9CQG1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chac2Q9CQG1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chac2Q9CQG1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chac2Q9CQG1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chac2Q9CQG1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chac2Q9CQG1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chac2Q9CQG1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chac2Q9CQG1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chac2Q9CQG1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chac2Q9CQG1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chac2Q9CQG1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chac2Q9CQG1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chac2Q9CQG1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chac2Q9CQG1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chac2Q9CQG1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms