Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ubqln4Q99NB8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ubqln4Q99NB8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ubqln4Q99NB8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubqln4Q99NB8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubqln4Q99NB8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ubqln4Q99NB8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubqln4Q99NB8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubqln4Q99NB8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubqln4Q99NB8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubqln4Q99NB8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubqln4Q99NB8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ubqln4Q99NB8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubqln4Q99NB8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubqln4Q99NB8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubqln4Q99NB8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ubqln4Q99NB8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubqln4Q99NB8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubqln4Q99NB8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubqln4Q99NB8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubqln4Q99NB8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubqln4Q99NB8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubqln4Q99NB8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubqln4Q99NB8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubqln4Q99NB8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ubqln4Q99NB8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubqln4Q99NB8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubqln4Q99NB8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubqln4Q99NB8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubqln4Q99NB8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubqln4Q99NB8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubqln4Q99NB8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubqln4Q99NB8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubqln4Q99NB8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubqln4Q99NB8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubqln4Q99NB8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubqln4Q99NB8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubqln4Q99NB8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubqln4Q99NB8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubqln4Q99NB8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubqln4Q99NB8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubqln4Q99NB8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubqln4Q99NB8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubqln4Q99NB8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubqln4Q99NB8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubqln4Q99NB8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubqln4Q99NB8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubqln4Q99NB8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubqln4Q99NB8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubqln4Q99NB8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubqln4Q99NB8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubqln4Q99NB8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubqln4Q99NB8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubqln4Q99NB8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubqln4Q99NB8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubqln4Q99NB8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubqln4Q99NB8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubqln4Q99NB8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubqln4Q99NB8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubqln4Q99NB8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubqln4Q99NB8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubqln4Q99NB8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubqln4Q99NB8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubqln4Q99NB8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubqln4Q99NB8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubqln4Q99NB8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubqln4Q99NB8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubqln4Q99NB8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubqln4Q99NB8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubqln4Q99NB8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubqln4Q99NB8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ubqln4Q99NB8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubqln4Q99NB8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubqln4Q99NB8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubqln4Q99NB8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubqln4Q99NB8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubqln4Q99NB8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubqln4Q99NB8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubqln4Q99NB8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubqln4Q99NB8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubqln4Q99NB8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubqln4Q99NB8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubqln4Q99NB8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubqln4Q99NB8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubqln4Q99NB8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubqln4Q99NB8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubqln4Q99NB8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubqln4Q99NB8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubqln4Q99NB8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubqln4Q99NB8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubqln4Q99NB8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubqln4Q99NB8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubqln4Q99NB8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ubqln4Q99NB8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubqln4Q99NB8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubqln4Q99NB8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubqln4Q99NB8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubqln4Q99NB8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubqln4Q99NB8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubqln4Q99NB8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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