Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Alpk3Q924C5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Alpk3Q924C5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Alpk3Q924C5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Alpk3Q924C5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Alpk3Q924C5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Alpk3Q924C5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Alpk3Q924C5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Alpk3Q924C5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Alpk3Q924C5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Alpk3Q924C5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Alpk3Q924C5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Alpk3Q924C5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Alpk3Q924C5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Alpk3Q924C5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Alpk3Q924C5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Alpk3Q924C5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Alpk3Q924C5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Alpk3Q924C5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Alpk3Q924C5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
Alpk3Q924C5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Alpk3Q924C5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Alpk3Q924C5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
Alpk3Q924C5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Alpk3Q924C5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Alpk3Q924C5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Alpk3Q924C5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Alpk3Q924C5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Alpk3Q924C5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Alpk3Q924C5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Alpk3Q924C5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
Alpk3Q924C5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Alpk3Q924C5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Alpk3Q924C5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Alpk3Q924C5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Alpk3Q924C5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Alpk3Q924C5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Alpk3Q924C5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Alpk3Q924C5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
Alpk3Q924C5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Alpk3Q924C5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Alpk3Q924C5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Alpk3Q924C5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Alpk3Q924C5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Alpk3Q924C5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Alpk3Q924C5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
Alpk3Q924C5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Alpk3Q924C5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Alpk3Q924C5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Alpk3Q924C5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Alpk3Q924C5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Alpk3Q924C5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Alpk3Q924C5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Alpk3Q924C5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Alpk3Q924C5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Alpk3Q924C5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Alpk3Q924C5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Alpk3Q924C5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Alpk3Q924C5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Alpk3Q924C5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Alpk3Q924C5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Alpk3Q924C5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Alpk3Q924C5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Alpk3Q924C5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Alpk3Q924C5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Alpk3Q924C5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Alpk3Q924C5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Alpk3Q924C5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Alpk3Q924C5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Alpk3Q924C5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Alpk3Q924C5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Alpk3Q924C5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Alpk3Q924C5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Alpk3Q924C5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Alpk3Q924C5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Alpk3Q924C5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Alpk3Q924C5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Alpk3Q924C5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Alpk3Q924C5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Alpk3Q924C5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Alpk3Q924C5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Alpk3Q924C5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Alpk3Q924C5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Alpk3Q924C5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Alpk3Q924C5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Alpk3Q924C5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Alpk3Q924C5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Alpk3Q924C5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Alpk3Q924C5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Alpk3Q924C5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Alpk3Q924C5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Alpk3Q924C5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Alpk3Q924C5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Alpk3Q924C5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Alpk3Q924C5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Alpk3Q924C5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Alpk3Q924C5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Alpk3Q924C5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.15
Alpk3Q924C5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Alpk3Q924C5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms