Protein–RNA interactions for Protein: Q91YW3

Dnajc3, DnaJ homolog subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc3Q91YW3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Dnajc3Q91YW3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Dnajc3Q91YW3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Dnajc3Q91YW3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Dnajc3Q91YW3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Dnajc3Q91YW3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Dnajc3Q91YW3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Dnajc3Q91YW3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Dnajc3Q91YW3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Dnajc3Q91YW3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnajc3Q91YW3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Dnajc3Q91YW3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Dnajc3Q91YW3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Dnajc3Q91YW3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Dnajc3Q91YW3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Dnajc3Q91YW3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Dnajc3Q91YW3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dnajc3Q91YW3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Dnajc3Q91YW3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Dnajc3Q91YW3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Dnajc3Q91YW3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Dnajc3Q91YW3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Dnajc3Q91YW3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Dnajc3Q91YW3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Dnajc3Q91YW3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Dnajc3Q91YW3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Dnajc3Q91YW3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Dnajc3Q91YW3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Dnajc3Q91YW3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Dnajc3Q91YW3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Dnajc3Q91YW3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Dnajc3Q91YW3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Dnajc3Q91YW3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Dnajc3Q91YW3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Dnajc3Q91YW3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnajc3Q91YW3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Dnajc3Q91YW3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dnajc3Q91YW3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Dnajc3Q91YW3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnajc3Q91YW3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Dnajc3Q91YW3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnajc3Q91YW3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dnajc3Q91YW3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnajc3Q91YW3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Dnajc3Q91YW3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dnajc3Q91YW3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dnajc3Q91YW3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Dnajc3Q91YW3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnajc3Q91YW3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnajc3Q91YW3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnajc3Q91YW3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Dnajc3Q91YW3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnajc3Q91YW3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnajc3Q91YW3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnajc3Q91YW3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Dnajc3Q91YW3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnajc3Q91YW3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dnajc3Q91YW3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnajc3Q91YW3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dnajc3Q91YW3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dnajc3Q91YW3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dnajc3Q91YW3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dnajc3Q91YW3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dnajc3Q91YW3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnajc3Q91YW3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnajc3Q91YW3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnajc3Q91YW3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnajc3Q91YW3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dnajc3Q91YW3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnajc3Q91YW3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dnajc3Q91YW3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnajc3Q91YW3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnajc3Q91YW3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnajc3Q91YW3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnajc3Q91YW3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnajc3Q91YW3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnajc3Q91YW3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Dnajc3Q91YW3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dnajc3Q91YW3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dnajc3Q91YW3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Dnajc3Q91YW3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dnajc3Q91YW3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Dnajc3Q91YW3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Dnajc3Q91YW3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dnajc3Q91YW3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnajc3Q91YW3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Dnajc3Q91YW3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnajc3Q91YW3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnajc3Q91YW3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnajc3Q91YW3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnajc3Q91YW3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnajc3Q91YW3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnajc3Q91YW3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnajc3Q91YW3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnajc3Q91YW3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnajc3Q91YW3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnajc3Q91YW3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnajc3Q91YW3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnajc3Q91YW3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnajc3Q91YW3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms