Protein–RNA interactions for Protein: Q91YL3

Uckl1, Uridine-cytidine kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uckl1Q91YL3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Uckl1Q91YL3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Uckl1Q91YL3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Uckl1Q91YL3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Uckl1Q91YL3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Uckl1Q91YL3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Uckl1Q91YL3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Uckl1Q91YL3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Uckl1Q91YL3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Uckl1Q91YL3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uckl1Q91YL3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Uckl1Q91YL3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Uckl1Q91YL3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uckl1Q91YL3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uckl1Q91YL3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Uckl1Q91YL3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uckl1Q91YL3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uckl1Q91YL3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uckl1Q91YL3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uckl1Q91YL3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uckl1Q91YL3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Uckl1Q91YL3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uckl1Q91YL3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uckl1Q91YL3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uckl1Q91YL3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uckl1Q91YL3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uckl1Q91YL3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uckl1Q91YL3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uckl1Q91YL3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Uckl1Q91YL3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uckl1Q91YL3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uckl1Q91YL3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uckl1Q91YL3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uckl1Q91YL3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Uckl1Q91YL3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Uckl1Q91YL3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uckl1Q91YL3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uckl1Q91YL3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uckl1Q91YL3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uckl1Q91YL3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uckl1Q91YL3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uckl1Q91YL3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uckl1Q91YL3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uckl1Q91YL3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Uckl1Q91YL3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uckl1Q91YL3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Uckl1Q91YL3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uckl1Q91YL3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Uckl1Q91YL3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uckl1Q91YL3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uckl1Q91YL3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uckl1Q91YL3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uckl1Q91YL3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uckl1Q91YL3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Uckl1Q91YL3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uckl1Q91YL3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uckl1Q91YL3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uckl1Q91YL3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Uckl1Q91YL3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uckl1Q91YL3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uckl1Q91YL3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uckl1Q91YL3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uckl1Q91YL3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Uckl1Q91YL3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uckl1Q91YL3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uckl1Q91YL3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uckl1Q91YL3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uckl1Q91YL3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uckl1Q91YL3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Uckl1Q91YL3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uckl1Q91YL3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uckl1Q91YL3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uckl1Q91YL3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uckl1Q91YL3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uckl1Q91YL3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uckl1Q91YL3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Uckl1Q91YL3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uckl1Q91YL3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uckl1Q91YL3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uckl1Q91YL3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uckl1Q91YL3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uckl1Q91YL3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uckl1Q91YL3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uckl1Q91YL3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uckl1Q91YL3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uckl1Q91YL3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uckl1Q91YL3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uckl1Q91YL3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uckl1Q91YL3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uckl1Q91YL3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uckl1Q91YL3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Uckl1Q91YL3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uckl1Q91YL3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uckl1Q91YL3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uckl1Q91YL3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uckl1Q91YL3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uckl1Q91YL3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uckl1Q91YL3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Uckl1Q91YL3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Uckl1Q91YL3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms