Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ2

Pcdhb8, Protocadherin beta-8, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb8Q91XZ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Pcdhb8Q91XZ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pcdhb8Q91XZ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pcdhb8Q91XZ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcdhb8Q91XZ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pcdhb8Q91XZ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcdhb8Q91XZ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Pcdhb8Q91XZ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcdhb8Q91XZ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcdhb8Q91XZ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcdhb8Q91XZ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcdhb8Q91XZ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pcdhb8Q91XZ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Pcdhb8Q91XZ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Pcdhb8Q91XZ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pcdhb8Q91XZ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcdhb8Q91XZ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcdhb8Q91XZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcdhb8Q91XZ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcdhb8Q91XZ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcdhb8Q91XZ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcdhb8Q91XZ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcdhb8Q91XZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcdhb8Q91XZ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcdhb8Q91XZ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcdhb8Q91XZ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcdhb8Q91XZ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcdhb8Q91XZ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcdhb8Q91XZ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcdhb8Q91XZ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcdhb8Q91XZ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcdhb8Q91XZ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcdhb8Q91XZ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcdhb8Q91XZ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcdhb8Q91XZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pcdhb8Q91XZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcdhb8Q91XZ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcdhb8Q91XZ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcdhb8Q91XZ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdhb8Q91XZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdhb8Q91XZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcdhb8Q91XZ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdhb8Q91XZ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcdhb8Q91XZ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdhb8Q91XZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdhb8Q91XZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcdhb8Q91XZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pcdhb8Q91XZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdhb8Q91XZ2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcdhb8Q91XZ2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcdhb8Q91XZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcdhb8Q91XZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcdhb8Q91XZ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdhb8Q91XZ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdhb8Q91XZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcdhb8Q91XZ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcdhb8Q91XZ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcdhb8Q91XZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcdhb8Q91XZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcdhb8Q91XZ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcdhb8Q91XZ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcdhb8Q91XZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcdhb8Q91XZ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcdhb8Q91XZ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcdhb8Q91XZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcdhb8Q91XZ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcdhb8Q91XZ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcdhb8Q91XZ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcdhb8Q91XZ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcdhb8Q91XZ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcdhb8Q91XZ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcdhb8Q91XZ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcdhb8Q91XZ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcdhb8Q91XZ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcdhb8Q91XZ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcdhb8Q91XZ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcdhb8Q91XZ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcdhb8Q91XZ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcdhb8Q91XZ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcdhb8Q91XZ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcdhb8Q91XZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcdhb8Q91XZ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcdhb8Q91XZ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcdhb8Q91XZ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcdhb8Q91XZ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcdhb8Q91XZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcdhb8Q91XZ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcdhb8Q91XZ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcdhb8Q91XZ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcdhb8Q91XZ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcdhb8Q91XZ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcdhb8Q91XZ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcdhb8Q91XZ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcdhb8Q91XZ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcdhb8Q91XZ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcdhb8Q91XZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcdhb8Q91XZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcdhb8Q91XZ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcdhb8Q91XZ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcdhb8Q91XZ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms