Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Capn8Q91VA3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Capn8Q91VA3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Capn8Q91VA3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Capn8Q91VA3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Capn8Q91VA3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Capn8Q91VA3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Capn8Q91VA3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
Capn8Q91VA3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Capn8Q91VA3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Capn8Q91VA3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Capn8Q91VA3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Capn8Q91VA3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Capn8Q91VA3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Capn8Q91VA3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Capn8Q91VA3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Capn8Q91VA3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Capn8Q91VA3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Capn8Q91VA3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Capn8Q91VA3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Capn8Q91VA3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Capn8Q91VA3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Capn8Q91VA3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Capn8Q91VA3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Capn8Q91VA3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Capn8Q91VA3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Capn8Q91VA3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Capn8Q91VA3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Capn8Q91VA3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Capn8Q91VA3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Capn8Q91VA3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Capn8Q91VA3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Capn8Q91VA3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Capn8Q91VA3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Capn8Q91VA3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Capn8Q91VA3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Capn8Q91VA3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Capn8Q91VA3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Capn8Q91VA3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Capn8Q91VA3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Capn8Q91VA3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Capn8Q91VA3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Capn8Q91VA3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Capn8Q91VA3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Capn8Q91VA3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Capn8Q91VA3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn8Q91VA3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn8Q91VA3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Capn8Q91VA3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Capn8Q91VA3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Capn8Q91VA3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Capn8Q91VA3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn8Q91VA3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capn8Q91VA3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Capn8Q91VA3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Capn8Q91VA3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Capn8Q91VA3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Capn8Q91VA3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn8Q91VA3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Capn8Q91VA3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn8Q91VA3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Capn8Q91VA3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Capn8Q91VA3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Capn8Q91VA3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Capn8Q91VA3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Capn8Q91VA3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Capn8Q91VA3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Capn8Q91VA3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Capn8Q91VA3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Capn8Q91VA3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Capn8Q91VA3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Capn8Q91VA3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Capn8Q91VA3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Capn8Q91VA3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn8Q91VA3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn8Q91VA3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn8Q91VA3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn8Q91VA3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Capn8Q91VA3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Capn8Q91VA3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Capn8Q91VA3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Capn8Q91VA3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Capn8Q91VA3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn8Q91VA3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Capn8Q91VA3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capn8Q91VA3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capn8Q91VA3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capn8Q91VA3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capn8Q91VA3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn8Q91VA3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn8Q91VA3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn8Q91VA3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Capn8Q91VA3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capn8Q91VA3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Capn8Q91VA3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn8Q91VA3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Capn8Q91VA3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Capn8Q91VA3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Capn8Q91VA3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Capn8Q91VA3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms