Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2P6

Rfesd, Rieske domain-containing protein, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfesdQ8K2P6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RfesdQ8K2P6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RfesdQ8K2P6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RfesdQ8K2P6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RfesdQ8K2P6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RfesdQ8K2P6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RfesdQ8K2P6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RfesdQ8K2P6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RfesdQ8K2P6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RfesdQ8K2P6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RfesdQ8K2P6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RfesdQ8K2P6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RfesdQ8K2P6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RfesdQ8K2P6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RfesdQ8K2P6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RfesdQ8K2P6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RfesdQ8K2P6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RfesdQ8K2P6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RfesdQ8K2P6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RfesdQ8K2P6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RfesdQ8K2P6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RfesdQ8K2P6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RfesdQ8K2P6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RfesdQ8K2P6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RfesdQ8K2P6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RfesdQ8K2P6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RfesdQ8K2P6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RfesdQ8K2P6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RfesdQ8K2P6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RfesdQ8K2P6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RfesdQ8K2P6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RfesdQ8K2P6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RfesdQ8K2P6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RfesdQ8K2P6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RfesdQ8K2P6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RfesdQ8K2P6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RfesdQ8K2P6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RfesdQ8K2P6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RfesdQ8K2P6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RfesdQ8K2P6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RfesdQ8K2P6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RfesdQ8K2P6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RfesdQ8K2P6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RfesdQ8K2P6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RfesdQ8K2P6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RfesdQ8K2P6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RfesdQ8K2P6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RfesdQ8K2P6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RfesdQ8K2P6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RfesdQ8K2P6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RfesdQ8K2P6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RfesdQ8K2P6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RfesdQ8K2P6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RfesdQ8K2P6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RfesdQ8K2P6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RfesdQ8K2P6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RfesdQ8K2P6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RfesdQ8K2P6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RfesdQ8K2P6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RfesdQ8K2P6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RfesdQ8K2P6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RfesdQ8K2P6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RfesdQ8K2P6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RfesdQ8K2P6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RfesdQ8K2P6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RfesdQ8K2P6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RfesdQ8K2P6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RfesdQ8K2P6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RfesdQ8K2P6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RfesdQ8K2P6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RfesdQ8K2P6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RfesdQ8K2P6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RfesdQ8K2P6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RfesdQ8K2P6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RfesdQ8K2P6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RfesdQ8K2P6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RfesdQ8K2P6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RfesdQ8K2P6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RfesdQ8K2P6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RfesdQ8K2P6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RfesdQ8K2P6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RfesdQ8K2P6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RfesdQ8K2P6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RfesdQ8K2P6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RfesdQ8K2P6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RfesdQ8K2P6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RfesdQ8K2P6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RfesdQ8K2P6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RfesdQ8K2P6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RfesdQ8K2P6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RfesdQ8K2P6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RfesdQ8K2P6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RfesdQ8K2P6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RfesdQ8K2P6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RfesdQ8K2P6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RfesdQ8K2P6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RfesdQ8K2P6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RfesdQ8K2P6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RfesdQ8K2P6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RfesdQ8K2P6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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