Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2A4

Zfp87, MCG140700, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp87Q8K2A4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Zfp87Q8K2A4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zfp87Q8K2A4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zfp87Q8K2A4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zfp87Q8K2A4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp87Q8K2A4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfp87Q8K2A4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp87Q8K2A4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Zfp87Q8K2A4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp87Q8K2A4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp87Q8K2A4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp87Q8K2A4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp87Q8K2A4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp87Q8K2A4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp87Q8K2A4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp87Q8K2A4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zfp87Q8K2A4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp87Q8K2A4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp87Q8K2A4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp87Q8K2A4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp87Q8K2A4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp87Q8K2A4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp87Q8K2A4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp87Q8K2A4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp87Q8K2A4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zfp87Q8K2A4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp87Q8K2A4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp87Q8K2A4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp87Q8K2A4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp87Q8K2A4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp87Q8K2A4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zfp87Q8K2A4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zfp87Q8K2A4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp87Q8K2A4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp87Q8K2A4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp87Q8K2A4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp87Q8K2A4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp87Q8K2A4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp87Q8K2A4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp87Q8K2A4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp87Q8K2A4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp87Q8K2A4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp87Q8K2A4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp87Q8K2A4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp87Q8K2A4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp87Q8K2A4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp87Q8K2A4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp87Q8K2A4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp87Q8K2A4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp87Q8K2A4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp87Q8K2A4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp87Q8K2A4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp87Q8K2A4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp87Q8K2A4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp87Q8K2A4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp87Q8K2A4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp87Q8K2A4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp87Q8K2A4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp87Q8K2A4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp87Q8K2A4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp87Q8K2A4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp87Q8K2A4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp87Q8K2A4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp87Q8K2A4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp87Q8K2A4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp87Q8K2A4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp87Q8K2A4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp87Q8K2A4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp87Q8K2A4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp87Q8K2A4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp87Q8K2A4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp87Q8K2A4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp87Q8K2A4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp87Q8K2A4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp87Q8K2A4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp87Q8K2A4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp87Q8K2A4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp87Q8K2A4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp87Q8K2A4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp87Q8K2A4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp87Q8K2A4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp87Q8K2A4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp87Q8K2A4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp87Q8K2A4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp87Q8K2A4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp87Q8K2A4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp87Q8K2A4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp87Q8K2A4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp87Q8K2A4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp87Q8K2A4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp87Q8K2A4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp87Q8K2A4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp87Q8K2A4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp87Q8K2A4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp87Q8K2A4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp87Q8K2A4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp87Q8K2A4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp87Q8K2A4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp87Q8K2A4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp87Q8K2A4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms