Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE4

Parp10, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp10Q8CIE4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Parp10Q8CIE4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Parp10Q8CIE4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Parp10Q8CIE4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Parp10Q8CIE4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Parp10Q8CIE4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Parp10Q8CIE4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Parp10Q8CIE4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Parp10Q8CIE4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Parp10Q8CIE4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Parp10Q8CIE4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Parp10Q8CIE4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Parp10Q8CIE4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Parp10Q8CIE4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Parp10Q8CIE4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Parp10Q8CIE4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Parp10Q8CIE4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Parp10Q8CIE4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Parp10Q8CIE4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Parp10Q8CIE4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Parp10Q8CIE4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Parp10Q8CIE4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Parp10Q8CIE4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Parp10Q8CIE4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Parp10Q8CIE4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Parp10Q8CIE4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Parp10Q8CIE4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Parp10Q8CIE4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Parp10Q8CIE4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Parp10Q8CIE4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Parp10Q8CIE4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Parp10Q8CIE4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Parp10Q8CIE4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Parp10Q8CIE4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Parp10Q8CIE4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Parp10Q8CIE4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Parp10Q8CIE4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Parp10Q8CIE4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Parp10Q8CIE4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Parp10Q8CIE4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Parp10Q8CIE4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Parp10Q8CIE4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Parp10Q8CIE4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Parp10Q8CIE4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Parp10Q8CIE4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Parp10Q8CIE4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Parp10Q8CIE4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Parp10Q8CIE4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Parp10Q8CIE4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Parp10Q8CIE4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Parp10Q8CIE4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Parp10Q8CIE4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Parp10Q8CIE4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Parp10Q8CIE4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Parp10Q8CIE4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Parp10Q8CIE4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Parp10Q8CIE4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Parp10Q8CIE4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Parp10Q8CIE4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Parp10Q8CIE4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Parp10Q8CIE4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Parp10Q8CIE4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Parp10Q8CIE4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Parp10Q8CIE4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Parp10Q8CIE4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Parp10Q8CIE4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Parp10Q8CIE4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Parp10Q8CIE4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Parp10Q8CIE4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Parp10Q8CIE4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Parp10Q8CIE4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Parp10Q8CIE4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Parp10Q8CIE4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Parp10Q8CIE4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Parp10Q8CIE4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Parp10Q8CIE4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Parp10Q8CIE4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Parp10Q8CIE4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Parp10Q8CIE4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Parp10Q8CIE4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Parp10Q8CIE4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Parp10Q8CIE4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Parp10Q8CIE4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Parp10Q8CIE4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Parp10Q8CIE4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Parp10Q8CIE4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Parp10Q8CIE4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Parp10Q8CIE4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Parp10Q8CIE4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Parp10Q8CIE4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Parp10Q8CIE4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Parp10Q8CIE4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Parp10Q8CIE4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Parp10Q8CIE4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Parp10Q8CIE4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Parp10Q8CIE4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Parp10Q8CIE4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Parp10Q8CIE4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Parp10Q8CIE4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Parp10Q8CIE4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms