Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Atl1Q8BH66 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atl1Q8BH66 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atl1Q8BH66 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atl1Q8BH66 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Atl1Q8BH66 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Atl1Q8BH66 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Atl1Q8BH66 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atl1Q8BH66 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Atl1Q8BH66 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Atl1Q8BH66 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Atl1Q8BH66 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atl1Q8BH66 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Atl1Q8BH66 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Atl1Q8BH66 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atl1Q8BH66 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atl1Q8BH66 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atl1Q8BH66 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atl1Q8BH66 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atl1Q8BH66 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Atl1Q8BH66 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atl1Q8BH66 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atl1Q8BH66 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atl1Q8BH66 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atl1Q8BH66 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atl1Q8BH66 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atl1Q8BH66 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Atl1Q8BH66 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atl1Q8BH66 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atl1Q8BH66 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atl1Q8BH66 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atl1Q8BH66 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atl1Q8BH66 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atl1Q8BH66 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atl1Q8BH66 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atl1Q8BH66 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atl1Q8BH66 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Atl1Q8BH66 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atl1Q8BH66 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atl1Q8BH66 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atl1Q8BH66 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atl1Q8BH66 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atl1Q8BH66 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Atl1Q8BH66 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atl1Q8BH66 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atl1Q8BH66 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atl1Q8BH66 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atl1Q8BH66 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atl1Q8BH66 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atl1Q8BH66 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atl1Q8BH66 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atl1Q8BH66 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atl1Q8BH66 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atl1Q8BH66 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atl1Q8BH66 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atl1Q8BH66 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atl1Q8BH66 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atl1Q8BH66 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atl1Q8BH66 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atl1Q8BH66 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl1Q8BH66 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atl1Q8BH66 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl1Q8BH66 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atl1Q8BH66 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atl1Q8BH66 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atl1Q8BH66 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl1Q8BH66 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl1Q8BH66 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atl1Q8BH66 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atl1Q8BH66 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Atl1Q8BH66 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atl1Q8BH66 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atl1Q8BH66 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atl1Q8BH66 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atl1Q8BH66 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atl1Q8BH66 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atl1Q8BH66 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atl1Q8BH66 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atl1Q8BH66 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atl1Q8BH66 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atl1Q8BH66 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atl1Q8BH66 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atl1Q8BH66 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atl1Q8BH66 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atl1Q8BH66 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atl1Q8BH66 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atl1Q8BH66 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atl1Q8BH66 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atl1Q8BH66 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atl1Q8BH66 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atl1Q8BH66 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atl1Q8BH66 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atl1Q8BH66 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atl1Q8BH66 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atl1Q8BH66 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atl1Q8BH66 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atl1Q8BH66 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atl1Q8BH66 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl1Q8BH66 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl1Q8BH66 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms