Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG92

Clvs2, Clavesin-2, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs2Q8BG92 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Clvs2Q8BG92 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clvs2Q8BG92 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clvs2Q8BG92 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clvs2Q8BG92 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clvs2Q8BG92 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clvs2Q8BG92 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Clvs2Q8BG92 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clvs2Q8BG92 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Clvs2Q8BG92 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clvs2Q8BG92 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Clvs2Q8BG92 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clvs2Q8BG92 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clvs2Q8BG92 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Clvs2Q8BG92 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clvs2Q8BG92 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clvs2Q8BG92 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clvs2Q8BG92 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Clvs2Q8BG92 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clvs2Q8BG92 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clvs2Q8BG92 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clvs2Q8BG92 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clvs2Q8BG92 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clvs2Q8BG92 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clvs2Q8BG92 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clvs2Q8BG92 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clvs2Q8BG92 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Clvs2Q8BG92 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clvs2Q8BG92 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clvs2Q8BG92 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clvs2Q8BG92 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clvs2Q8BG92 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clvs2Q8BG92 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clvs2Q8BG92 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clvs2Q8BG92 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clvs2Q8BG92 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clvs2Q8BG92 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clvs2Q8BG92 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clvs2Q8BG92 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clvs2Q8BG92 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clvs2Q8BG92 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clvs2Q8BG92 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clvs2Q8BG92 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Clvs2Q8BG92 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clvs2Q8BG92 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Clvs2Q8BG92 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clvs2Q8BG92 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clvs2Q8BG92 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clvs2Q8BG92 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clvs2Q8BG92 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clvs2Q8BG92 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clvs2Q8BG92 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clvs2Q8BG92 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clvs2Q8BG92 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clvs2Q8BG92 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clvs2Q8BG92 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clvs2Q8BG92 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clvs2Q8BG92 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Clvs2Q8BG92 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clvs2Q8BG92 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clvs2Q8BG92 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clvs2Q8BG92 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clvs2Q8BG92 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clvs2Q8BG92 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clvs2Q8BG92 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clvs2Q8BG92 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clvs2Q8BG92 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clvs2Q8BG92 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clvs2Q8BG92 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clvs2Q8BG92 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clvs2Q8BG92 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clvs2Q8BG92 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clvs2Q8BG92 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clvs2Q8BG92 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clvs2Q8BG92 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clvs2Q8BG92 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clvs2Q8BG92 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clvs2Q8BG92 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clvs2Q8BG92 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clvs2Q8BG92 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clvs2Q8BG92 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clvs2Q8BG92 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clvs2Q8BG92 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clvs2Q8BG92 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clvs2Q8BG92 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clvs2Q8BG92 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clvs2Q8BG92 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clvs2Q8BG92 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clvs2Q8BG92 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clvs2Q8BG92 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clvs2Q8BG92 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clvs2Q8BG92 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clvs2Q8BG92 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clvs2Q8BG92 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clvs2Q8BG92 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clvs2Q8BG92 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clvs2Q8BG92 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clvs2Q8BG92 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clvs2Q8BG92 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clvs2Q8BG92 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms