Protein–RNA interactions for Protein: Q812A5

Prr5, Proline-rich protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr5Q812A5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Prr5Q812A5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Prr5Q812A5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prr5Q812A5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Prr5Q812A5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Prr5Q812A5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prr5Q812A5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Prr5Q812A5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Prr5Q812A5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prr5Q812A5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Prr5Q812A5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prr5Q812A5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Prr5Q812A5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prr5Q812A5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prr5Q812A5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Prr5Q812A5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prr5Q812A5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prr5Q812A5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prr5Q812A5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prr5Q812A5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr5Q812A5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prr5Q812A5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prr5Q812A5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prr5Q812A5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prr5Q812A5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prr5Q812A5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prr5Q812A5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Prr5Q812A5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prr5Q812A5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Prr5Q812A5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prr5Q812A5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prr5Q812A5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prr5Q812A5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prr5Q812A5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prr5Q812A5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr5Q812A5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr5Q812A5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr5Q812A5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prr5Q812A5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prr5Q812A5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prr5Q812A5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prr5Q812A5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Prr5Q812A5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr5Q812A5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prr5Q812A5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prr5Q812A5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Prr5Q812A5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prr5Q812A5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prr5Q812A5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prr5Q812A5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prr5Q812A5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prr5Q812A5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prr5Q812A5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prr5Q812A5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prr5Q812A5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prr5Q812A5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prr5Q812A5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prr5Q812A5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prr5Q812A5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prr5Q812A5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prr5Q812A5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prr5Q812A5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Prr5Q812A5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prr5Q812A5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prr5Q812A5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prr5Q812A5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prr5Q812A5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prr5Q812A5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prr5Q812A5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prr5Q812A5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prr5Q812A5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prr5Q812A5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prr5Q812A5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prr5Q812A5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prr5Q812A5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prr5Q812A5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prr5Q812A5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr5Q812A5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr5Q812A5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr5Q812A5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr5Q812A5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prr5Q812A5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr5Q812A5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr5Q812A5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr5Q812A5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr5Q812A5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr5Q812A5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prr5Q812A5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prr5Q812A5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prr5Q812A5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prr5Q812A5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prr5Q812A5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prr5Q812A5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prr5Q812A5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr5Q812A5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prr5Q812A5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prr5Q812A5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prr5Q812A5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prr5Q812A5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prr5Q812A5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms