Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
Npm2Q80W85 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
Npm2Q80W85 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Npm2Q80W85 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
Npm2Q80W85 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Npm2Q80W85 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Npm2Q80W85 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Npm2Q80W85 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Npm2Q80W85 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Npm2Q80W85 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Npm2Q80W85 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
Npm2Q80W85 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Npm2Q80W85 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Npm2Q80W85 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Npm2Q80W85 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Npm2Q80W85 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Npm2Q80W85 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
Npm2Q80W85 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Npm2Q80W85 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Npm2Q80W85 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Npm2Q80W85 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Npm2Q80W85 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
Npm2Q80W85 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Npm2Q80W85 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Npm2Q80W85 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Npm2Q80W85 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Npm2Q80W85 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Npm2Q80W85 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Npm2Q80W85 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Npm2Q80W85 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Npm2Q80W85 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Npm2Q80W85 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Npm2Q80W85 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Npm2Q80W85 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Npm2Q80W85 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Npm2Q80W85 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Npm2Q80W85 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
Npm2Q80W85 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
Npm2Q80W85 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Npm2Q80W85 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Npm2Q80W85 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
Npm2Q80W85 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Npm2Q80W85 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
Npm2Q80W85 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Npm2Q80W85 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Npm2Q80W85 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Npm2Q80W85 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Npm2Q80W85 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Npm2Q80W85 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Npm2Q80W85 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Npm2Q80W85 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Npm2Q80W85 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Npm2Q80W85 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Npm2Q80W85 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Npm2Q80W85 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Npm2Q80W85 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Npm2Q80W85 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Npm2Q80W85 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Npm2Q80W85 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
Npm2Q80W85 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Npm2Q80W85 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
Npm2Q80W85 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Npm2Q80W85 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Npm2Q80W85 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Npm2Q80W85 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Npm2Q80W85 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Npm2Q80W85 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Npm2Q80W85 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Npm2Q80W85 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Npm2Q80W85 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Npm2Q80W85 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.68■■■■■ 4.58
Npm2Q80W85 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Npm2Q80W85 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Npm2Q80W85 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Npm2Q80W85 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
Npm2Q80W85 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
Npm2Q80W85 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Npm2Q80W85 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Npm2Q80W85 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.57
Npm2Q80W85 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
Npm2Q80W85 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Npm2Q80W85 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Npm2Q80W85 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Npm2Q80W85 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Npm2Q80W85 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Npm2Q80W85 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Npm2Q80W85 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
Npm2Q80W85 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Npm2Q80W85 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
Npm2Q80W85 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Npm2Q80W85 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Npm2Q80W85 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Npm2Q80W85 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Npm2Q80W85 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Npm2Q80W85 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Npm2Q80W85 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Npm2Q80W85 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Npm2Q80W85 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Npm2Q80W85 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Npm2Q80W85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms